GOPathway数据筛选–GCBI学院.docxVIP

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  • 2021-04-13 发布于天津
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数据筛选学院功能分析显著性筛选显著性值采用精确检验对功能分析结果的显著性判断选择的功能为具有显著统计学意义的功能显著性值为了控制多重比较检验中犯第一类错误的整体概率我们通过的方法来控制即判断为显著性的中假阳性的比例的期望一般选择是较为理想的结果表示对应的功能具有显著统计学意义参考文献二自定义筛选关注的基因关键字根据用户关注的基因或功能名称中包含的关键字进行筛选可同时输入多个基因关键字信号通路分析显著性筛选显著性值采用精确检验对通路分析结果的显著性判断选择的通路为具有显著统计学意义显著性值为了控制

Series B 57 Series B 57 ⑴:289 4300. GOPathway 数据筛选 -GCBI学院 GO 功能分析 、显著性筛选 显著性 P 值 采用 Fisher 精确检验, 对功能分析结果的显著性判断, 选择 Plt;0.05 的功能为具有显著统计学意义的功能。 显著性 FDR 值 为了控制多重比较检验中犯第一类错误的整体概率,我们通 过 Benjamini-Hochberg step-up 的方法来控制 FDR ,即判 断为显著性的 GO 中假阳性 GO 的比例的期望,一般选择 FDRlt;0.05 是较为理想的结果,表示对应的功能具有显著 统计学意义。 参考文献:

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