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“生物信息学”教学模式探索
摘要:随着自然科学、生命科学研究进入迅猛发展阶段,开设生物技术专业的地方农业高校逐步增多,而“生物信息学”是吉林农业大学生物技术专业的核心课程,是生命科学与大数据信息发展过程中的重要课程。本文针对吉林农业大学生物技术专业的生物信息学教学现状,分析和总结了教学环节中存在的主要问题,尝试从教材的选用、教学方法及教学改进三个方面对生物信息学教学体系的改革提出建议,希望对生命科学体系的教学改革提供一些帮助。
关键词:生物技术专业;生物信息学;教学方法;教学改革
生物信息学(Bioinformatics)是随着人类基因组计划完成,越来越多物种的全基因组测序计划开启。生物信息学又是一门集数学、计算机科学和生物学于一体的综合性学科,是从海量生物学数据信息中获取、处理、存储、解析和阐述等,并利用数学和计算科学来解析生命科学奥秘的交叉学科。它是当今生命科学和自然科学的前沿领域之一,也是21世纪生物技术的核心领域,具有前沿性新、交叉性广、实践性强等特点[1]。因此,地方农业研究型高校开设的生物技术专业会将生物信息学课程作为人才培养方案中的核心课程,以满足生物技术行业对人才的迫切需要。在生物技术专业的课程中,生物信息学是生物技术专业重要的专业核心课,是基础课与专业课之间的纽带与桥梁课程,是成为生物技术专业教师开展科研工作的重要工具,也是生物专业本科生综合运用所学专业知识提升专业技能途径。生物信息学要学好,本科学生要有扎实的植物学、动物学、遗传学、细胞生物学、生物化学和分子生物学等基础生物学知识,但由于地方农业院校基础课程教学相对薄弱,学生的基础知识较为匮乏,同时教师多以传统的“讲解式”和“启发式”教学方法为主,教学内容紧凑且进度快,实验操作较少,使得学生在学习“生物信息学”课程时听不懂、记不住、学不好,直接影响并降低了学生的学习积极性。本文针对吉林农业大学生物技术专业的生物信息学课程的教学现状,分析和总结了教学环节中存在的主要问题,从教学方法、课程内容和考核方式等几个角度进行教学模式的探讨,以期在今后的教学环节取得更好的教学效果,提升学生对该课程的学习兴趣。
1地方农业高校生物信息学课程的教学现状与存在问题
生物信息学是一门集多学科知识体系综合交叉性强的前沿学科,对该课程的专业教师要求储备较强的生物科学知识和计算科学知识,还要将科学前沿知识与课程教育相融合,更要建立系统的完善的生物信息学知识板块,这些都导致地方农业高校缺乏生物信息学师资队伍,并影响我国农业生物信息学教育快速发展。1.1教学资源匮乏,教学内容过于陈旧。近些年,生物信息学发展速度较快,但地方农业高等院校开设时间相对较晚,课程设置内容单一、课程的建设方面投入较少。生物信息学是一门新兴学科,学科发展时间较短,缺少丰富的多媒体资源、教学视频、精品课等重要的教学资源,使其教学资源稀缺匮乏。同时,使用的教材和教学内容过于陈旧,不能满足学科的快速发展,更不能及时进行教学内容的更新。1.2学生专业知识基础差,理论功底不扎实。地方农业院校的学生在知识储备和数据分析能力上与综合性大学理工科学生存在差距。生物信息学课程理论性较强,地方农业高校学生在数学、计算机和专业英语等基础知识方面不够扎实,对生物信息学涉及的核心原理、应用算法等内容难以理解和消化,这些因素导致地方农业高校学生接受生物信息学课程的重要知识点存在较大困难,从而使部分学生的学习效果较差,不能灵活运用所学。1.3教学模式单一,学时少。目前,国内的生物信息学依旧是讲授式的传统教学模式,以理论讲授为主体,实验操作为辅助,以课堂为中心进行“满堂灌”式教育,从而导致缺乏突出生物信息学课程特点的新式教学模式。以一般地方农业高校的生物信息学课程总学时32学时,理论教学为24学时,实验学时仅为8学时,学时数较少,理论基础讲解不透彻,实验操作内容简单,对学生感兴趣和具有实际应用价值的软件无法进一步操作和实践应用。
2地方农业高校生物信息学教学模式的改革建议
2.1权威优质教材的选用。优质的教材是一门课程有序延伸的基础。生物信息学起源于国外,早期的课程教材均以翻译本为主,近几年我国生命科学发展较快,国内学者编著的教材越来越多,后期的教材均以国产教材为主,翻译教材为辅。但教材的数目繁多,2018年,曾有学者对我国这门学科教材进行评价,主要将其分为两大类,一类以生物信息学基本理论知识的讲解为主,主要介绍生物信息学发展史,与生物信息学相关的生物学理论,例如,
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