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乙醇沉淀dna和异丙醇沉淀dna的区别
异丙醇和酒精都是有机溶剂,一般来讲,提取质粒的时候一开
始都要用异丙醇沉淀,因为异丙醇沉淀的效果要好一些,但最
后大多用酒精沉淀,因为酒精容易挥发,对下游的实验影响小
异丙醇比较疏水,能很更好地沉淀核酸,用乙醇的目的是
去盐,它比异丙醇更亲水,所以能去掉一些盐离子。 有时还用
70%的乙醇洗样品也是为了增加盐的溶解度。
在沉淀核酸时可用乙醇与异丙醇,乙醇的极性要强于异丙醇,
所以一般用2倍体积乙醇沉淀,但在多糖、蛋白含量高时,用异
丙醇沉淀可部分克服这种污染,尤其用异丙醇在室温下沉淀对
摆脱多糖、杂蛋白污染更为有效。
异丙醇沉淀核酸时,高浓度盐存在将使大量多糖存在在溶
液中,从而可达到去多糖的作用。但高浓度的盐存在会影响核
酸的进一步操作,因此必须用乙醇多次洗涤脱盐。
异丙醇:
优点:所需容积小且速度快,适用于浓度低,而体积大DNA
样品的沉淀。0.54~1.0倍体积的异丙醇可选择性沉淀DNA和大分
子rRNA和mRNA;但对5sRNA、tRNA和多糖产物不产生沉淀,一般
不需要在低温条件下长时间放置。
缺点:易使盐类 (如NaCl、蔗糖)与DNA共沉淀;在DNA沉
淀中异丙醇难以挥发除去,所以常规需要用70%的乙醇漂洗DNA
沉淀数次。
乙醇:
沉淀DNA乙醇是首选的有机溶剂,对盐类沉淀少,DNA沉淀
中所含的衡量乙醇易蒸发去处,不影响以后的实验。在适当的
盐浓度下,2倍样品容积的95%乙醇可有效沉淀DNA,对于RNA则
需要将乙醇量增加至2.5倍.
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