富集差异气泡图小工具说明文档.docxVIP

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富集差异气泡图小工具说明文档 功能: 利用富集分析结果绘制富集差异气泡图,包含GO/KEGG/DO/Reactome四种数据类型。 输入: 输入文件: 格式:文件必须是带有表头的以tab分隔的.txt格式文件,表格名称以字母、数字、下划 线组成,不可以有后缀名称; 绘图方式:以列号形式读取数据,规定第4列为差异上调基因数目,第5列为差异下调 基因数日,第6列为P/Q值,筛选P/Q值最小的前20行数据绘制气泡图。 文件类型: Typel:包含6列数据 第1列:一级/A级分类 第 2 列:GO/KEGG/DO/Reactome 注释 ID 号 第 3 列:Term/Pathway 名称 第4列:属于这个通路的差异上调基因数 第5列:属于这个通路的差异下调基因数 第6列:富集分析的P值/Q值 注:最终绘制的图中,横坐标up-down normalization=(差异上调基因数■差异下调基因数)/ (差异上调基因数+差异下调基因数) 表格如下表所示: GO数据库 class ID Descrption Up Down Pvalue Biological Process G0:0007155 cell adhesion 50 21 2. 83E-26 Biological Process GO:0022610 biological adhes 50 21 2. 83E-26 Biological Process GO:0044403 symbiosis, encon 23 25 6. 57E-19 Biological Process GO:0044419 interspecies int 23 25 6. 57ET9 Biological Process GO:0051704 multi-organism p: 23 25 6. 57E-19 Biological Process GO:0030198 extracellular ma 18 12 4. 73E-17 Biological Process GO:0043062 extracellular st: 18 12 4. 73E-17 Biological Process 00:0006928 movement of cell 38 20 3. 50E-15 Biological Process GO:0048870 cell motility 38 20 3. 50E-15 Biological Process GO:0051674 localization of 38 20 3. 50E-15 Biological Process GO:0040011 locomotion 41 21 Biological Process GO:0008283 cell proliferati 40 27 2. 08E-14 Biological Process GO:0048646 anatomical struc 29 17 2. 59E-14 Biological Process GO:0034330 cell junction or 15 9 7. 44E-14 Biological Process GO:0048856 anatomical struc 76 47 7. 28E-13 Biological Process GO:0032502 developmental pr 77 50 Biological Process GO:0006950 response to stre 60 35 2. 83E-12 Biological Process GO:0002376 immune system pr 60 19 9. 54E-12 Biological Process GO:0009653 anatomical struc 36 21 Biological Process GO:0008219 cell death 37 27 2. 26E-11 KEGG数据库 class ID Desorption Up Down Pvalue EnvironmGko04512 ECM-receptor intei 9 3 Cellular ko04510 Focal adhesion 6 9 Human Disko05222 Small cell lung cs 6 2 Human Disko05165 Human papillomavii 12 4 Human Disko05412 Arrhythmogenic ri| 6 1 Human Disko05133 Pertussis 3 4 0rganismsko04610 Complement and coe 5 2 Environ

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