基于生物信息学途径筛选缺血性脑卒中关键基因及药物预测.docx

摘要 目的筛选缺血性脑卒中的关键基因及重要信号通路，预测可能对脑卒中有用的药物。方法从GEO数据库下载GSE98319基因芯片数据，该数据包含了假手术组、大脑中动脉梗塞组（MCAO）小鼠的基因芯片检测结果。用R语言的Limma包对数据进行差异表达分析，P0.05且|log2FC|0.6的基因为差异表达基因。借助STRING网站构建差异表达基因的蛋白质相互作用网络（PPIN）后由Cytoscape软件进行核心子网络筛选及可视化输出。筛选出核心基因后用实时荧光定量PCR（qRT- PCR）验证核心基因在脑缺血小鼠大脑皮层的表达情况。基因集富集分析（GSEA）算法用于京都基因与基因组百科全书（KEG