基于生物信息学途径食管鳞癌lncRNA预后风险模型的构建.docx

摘要 目的基于癌症基因组图谱（TCGA）数据库食管鳞癌lncRNA差异表达，构建食管鳞癌预后风险模型。方法从TCGA肿瘤数据库下载食管鳞癌基因表达数据及临床信息，使用R 4.0.3软件提取差异表达lncRNA，进一步使用COX回归分析筛选模型lncRNA，并构建预后风险模型Riskscore；按照风险评分中位值将食管鳞癌患者分为低风险组和高风险组，进一步比较高低风险组生存预后；分析比较风险模型及其他临床特征对食管鳞癌生存预后的预测性能；分析风险评分与其他临床特征相关性；采用主成分分析（PCA）及基因富集分析（GSEA）探索高低风险组基因分布差异。结果得到差异表达lncRNA174个，食管鳞癌组