质粒DNA的提取、纯化和电泳检测.docxVIP

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质粒 质粒 DNA的提取、纯化和电泳检测 质粒 DNA的提取、 纯化和电泳检 测 姓名 学号 同组人 班级 实验时间 摘要: 质粒是细菌细胞中与主染色体共存、可自主复制的一段大多数呈环形的 DNA,它是基因工程中一种 非常重要的载体。质粒 DNA的提取成为分子生物学实验室一项最基本的工作。碱变性提取法是一种应用最 为广泛的制备质粒 DNA的方法。电泳是带电物质在电场中向着与其电荷相反的电极移动的现象。凝胶电泳 可用于分离、 鉴定和纯化 DNA片段, 是分子生物学的核心技术之一。 本次实验利用碱变法对 E.coli DH5 受体菌中质粒 pUC19的 DNA进行提取、纯化和电泳检测,旨在学习并掌握质粒 DNA提取的原理、纯化及琼 脂糖凝胶电泳技术。通过此次实验,我们达到了预期效果。 关键词: 质粒 DNA、碱变性提取法、质粒 DNA的纯化、 DNA凝胶电泳 1. 引言 质粒是细菌细胞中与主染色体共存、 可自主 复制的一段大多数呈环形的 DNA。细菌质粒的相 对分子质量大小从 1kb 至 200kb 以上不等。一些 质粒永远独立于染色体之外, 另外一些质粒在一 定条件下会可逆地整合到寄主染色体上, 随着染 色体的复制而复制,并通过细胞分裂传递到后 代。质粒在基因工程中质粒常被用做基因的载 体。目前,已发现有质粒的细菌有几百种,已知 的绝大多数的细菌质粒都是闭合环状 DNA分子 (简称 cccDNA)。 由于质粒分子小、便于分离和提取的特点, 在 DNA重组中,质粒或经过改造后的质粒可通过 连接外源基因构成重组体, 携带目的基因进入细 菌、动物细胞或植物体内进行扩增与表达, 因此 质粒是基因工程中一种非常重要的载体。 质粒特 征的分析已被广泛用于细菌种属鉴定、耐药性、 毒力及同源性分析。 近年来由于基因芯片技术的 出现,质粒基因探针的开发和应用也得到了飞速 的发展,所以这就要求我们从宿主细胞中提取高 质量的质粒 DNA。因此,质粒 DNA的提取成为分 子生物学实验室一项最基本的工作。 提取和纯化质粒 DNA的方法很多, 目前常用 的有:碱裂解 / 碱变性法、煮沸法、羟基磷灰石 柱层析法、 EB-氯化铯密度梯度离心法和 Wizard 法等。其中,碱变性提取法最为经典和常用,是 一种应用最为广泛的制备质粒 DNA的方法,是基 于染色体 DNA与质粒 DNA的变性与复性的差异而 达到分离目的,适用于不同量质粒 DNA的提取。 该方法操作简单, 易于操作, 一般实验室均可进 行。提取的质粒 DNA纯度高,可直接用于酶切、 序列测定及分析。 碱变性提取质粒 DNA一般包括三个基本步 骤:培养细菌细胞以扩增质粒; 收集和裂解细胞; 分离和纯化质粒 DNA。 在细菌细胞中, 染色体 DNA以双螺旋结构存 在,质粒 DNA以共价闭合环状形式存在。 细胞破 碎后,染色体 DNA和质粒 DNA均被释放出来, 但 是两者变性与复性所依赖的溶 pH值不同。在 pH12.6 的碱性条件下,染色体 DNA的氢键断裂, 双螺旋结构解开而变性; 质粒 DNA的大部分氢键 断裂,但超螺旋共价闭合环状的两条互补链不会 完全分离。当用 pH 值 4.8 的 KAc(或 NaAc)高 盐缓冲溶液调节碱性溶液至中性时, 变性的质粒 DNA可恢复原来的共价闭合环状超螺旋结构而溶 解于溶液中; 但染色体 DNA不能复性, 而是与不 稳定的大分子 RNA、蛋白质 -SDS复合物等一起形 成缠连的、 可见的白色絮状沉淀。 这种沉淀通过 离心,与复性的溶于溶液的质粒 DNA分离。溶于 上清液的质粒 DNA,可用无水乙醇和盐溶液,使 之凝聚而形成沉淀。由于 DNA和 RNA性质类似, 乙醇沉淀 DNA的同时, 也伴随着 RNA沉淀,可利 用 RNaseA将 RNA降解。质粒 DNA溶液中的 RNaseA 移不动同的速度可因不别同各移电动荷,量的大小不异,以及一些可溶性蛋白, 可通过酚 / 氯仿抽提除去, 最后获得纯度较高的质粒 DNA。 反的电电极泳移是动带的电现物象质。在各电种场生中 p中反它H具会的条向电有件分极相下子反移,动的筛可电效的以现应极解移象。离。动含成。有各带种电生荷 中异它带,电。具利其有离用中子分移的的子动电筛大离速效小子度 移不动同的速度可因 不别同各 移电动荷,量的 大小不 异, 同纯的化分D子NA。片因段而,,是凝分胶子电生泳物可学用的于核分心离技、术鉴之定一和。 凝胶电泳技术操作简单而迅速,分辨率高, 分辨范围极广。 此外,凝胶中 DNA的位置可以用 低浓度荧光插入染料如 EB 染色直接观察到,甚 至含量少至 20pg 的双链 DNA在紫外激发下也能 直接检测到。 溴化乙锭(EB)是一种具扁平分子的核酸染 料,可以插入到 DNA或 RNA分子的碱基之间,

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