(课件)-B型DNA仅仅是众多DNA双螺旋构象中的一种。在外界条件.pptVIP

第三十页，编辑于星期一：七点 四十六分。 第三十一页，编辑于星期一：七点 四十六分。 第三十二页，编辑于星期一：七点 四十六分。 鸟嘌呤四聚体 第三十三页，编辑于星期一：七点 四十六分。 第三十四页，编辑于星期一：七点 四十六分。 第四节 DNA的变性与复性 变性（denaturation）或解链（melting〕 复性（renaturation）或退火（annealing） 成核作用（nucleation） 拉拉链作用（Zippering） DNA的复性对片段有两个要求： (1) 互补顺序的碰撞和排列； (2) 碱基的正确配对和氢键的形成。 第三十五页，编辑于星期一：七点 四十六分。 下列因素可导致DNA变性： 高温、 酸、 碱、 尿素、 甲酰胺 DNA变性后物理性质发生的变化： （1）流体力学的性质发生改变：粘度下 降，而沉降速度增加； （2）提高了对紫外线的吸收能力，此称为 增色效应（hyperchromic effect）。 第三十六页，编辑于星期一：七点 四十六分。 双链DNA的A260=1.00（浓度为50μg/ml时，对波长260nm紫外线的吸收能力）； 单链DNA的A260=1.37； 游离碱基或核苷酸的A260=1.60。 解链温度（melting temperature, Tm）或熔点，Tm是A260的升高达到极大值一半时的温度。即是变性温度范围的中点。 影响变性的因素： 外部条件如温度和正离子的浓度。 浓度低于0.4mol/L，单价阳离子增高10倍， T m增加16.6° 第三十七页，编辑于星期一：七点 四十六分。 内部条件 GC含量及分子类型 当GC的含量上升1%，则Tm上升0.4℃ 马默多蒂（Marmur-Doty）关系式： Tm = 69.3+0.41(G +C)%， 或 GC%=（Tm-69.3）×2.44 第三十八页，编辑于星期一：七点 四十六分。 复性动力学公式 C 1 1 C0 2 1+KC0t1/2 根据复性动力学公式我们可以知到些什么？ 复性进行一半时 = = 第三十九页，编辑于星期一：七点 四十六分。 (1) 单链浓度随着时间的增大而减小； (2）反应速率取决于初始的单链浓度Co； (3) 以反应浓度和COt1/2为座标可绘复性曲线； (4) 通过COt1/2值可测原核生物基因组的大小； 已知大肠杆菌的基因组为4.2x106bp, COt1/2 = 9M.Sec COt1/2 （任何基因组DNA）/9M.sec = 任何基因组大小/4.2X106bp (5)原核生物基因组大小不同，复性曲线也不同； (6) 可用以区分真核生物和原核生物基因组。 第四十页，编辑于星期一：七点 四十六分。 第四十一页，编辑于星期一：七点 四十六分。 第四十二页，编辑于星期一：七点 四十六分。 第四十三页，编辑于星期一：七点 四十六分。 模型中的碱基配对有何重要性？ ①A-T,G-C配对可形成很好的线性氢键； ②A-T对和G-C对的几何形状一样，使双链距离相近，使双螺旋保持均一； ③碱基对处在同一平面内。不论核苷酸的顺序如何，都不影响双螺旋的结构； ④为DNA半保留复制奠定了基础。 第一页，编辑于星期一：七点 四十六分。  螺旋桨效应 第二页，编辑于星期一：七点 四十六分。 第三节DNA的结构和性质 一．DNA二级结构的稳定因素 (1)碱基对之间的氢键。 (2)碱基的堆集力。 它包括： ① 疏水作用； ② 范德华力； ③ 磷酸基的负电荷斥力； 第三页，编辑于星期一：七点 四十六分。 碱基配对及氢键形成 第四页，编辑于星期一：七点 四十六分。 第五页，编辑于星期一：七点 四十六分。 腺苷(AR) 脱氧胞苷(dCR) β1’,N9-糖苷键 β1’,N1-糖苷键 β1’ β1’ N9 N1 C2 C4 第六页，编辑于星期一：七点 四十六分。