一种用于新型冠状病毒感染患者无创诊断的肠道微生物基因标志物及其应用发明专利.pdfVIP

一种用于新型冠状病毒感染患者无创诊断的肠道微生物基因标志物及其应用发明专利.pdf

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(19)中华人民共和国国家知识产权局 (12)发明专利申请 (10)申请公布号 CN 112609024 A (43)申请公布日 2021.04.06 (21)申请号 202011628621.6 (22)申请日 2020.12.31 (71)申请人 郑州大学第一附属医院 地址 450052 河南省郑州市二七区建设东 路50号 (72)发明人 任志刚 王海宇 崔光莹 孙冉冉  余祖江  (74)专利代理机构 杭州中成专利事务所有限公 司 33212 代理人 朱莹莹 (51)Int.Cl. C12Q 1/70 (2006.01) C12Q 1/6869 (2018.01) C12N 15/11 (2006.01) 权利要求书2页 说明书7页 序列表3页 附图4页 (54)发明名称 一种用于新型冠状病毒感染患者无创诊断 的肠道微生物基因标志物及其应用 (57)摘要 本发明属于生物医药技术领域,具体涉及一 种用于新型冠状病毒感染患者无创诊断的肠道 微生物基因标志物及其应用。肠道微生物基因标 志物由SEQ  ID NO:1‑7所示的7种微生物基因组 成,所述微生物基因在人体肠道中富集。本发明 的微生物基因区别模型在新冠肺炎感染患者和 非感染者中实现了良好的区别能力,也验证了该 区别模型能够弥补RT‑PCR检测的不足,将感染新 冠病毒的疑似患者从健康人群的鉴定出来。 A 4 2 0 9 0 6 2 1 1 N C CN 112609024 A 权 利 要 求 书 1/2页 1.一种用于区别新型冠状病毒感染和非感染者的肠道微生物基因标志物,其特征在 于:由SEQ  ID NO:1‑7所示的7种微生物基因组成,所述微生物在肠道中富集。 2.一种用于检测权利要求1所述肠道微生物基因标志物的检测试剂,包括用于检测权 利要求1所述的SEQ  ID NO:1‑7所示的7种微生物基因的引物,所述引物序列为SEQ  ID NO: 8‑9。 3.权利要求2所述检测试剂在制备新型冠状病毒感染和非感染的区分检测试剂盒中的 应用,所述检测试剂适用于检测权利要求1所述的肠道微生物基因。 4.根据权利要求3所述的应用,其特征在于:新型冠状病毒感染者包括RT‑PCR检测阳性 的确诊患者及RT‑PCR检测阴性但IgG抗体阳性的临床诊断患者。 5.根据权利要求3所述的应用,其特征在于:对所述对象的粪便进行检测,以便确定该 样本是否包含所述的微生物基因,是否可以建立区别新型冠状病毒感染和非感染的微生物 基因模型。 6.根据权利要求5所述的应用,其特征在于:通过收集入组对象的粪便样本,抽提微生 物总DNA,完成微生物DNA的16S rDNA Miseq测序,检测是否存在权利要求1所述的7种微生 物基因。 7.根据权利要求5所述的应用,其特征在于:通过收集入组对象的粪便样本,抽提微生 物总DNA,进行肠道菌群的16S rDNA Miseq测序;基于高通量测序数据,在训练集中建立新 型冠状病毒感染和非感染者的微生物区别模型,建立新冠肺炎患病率(probability  of  disease,POD)指数;POD指数在验证集中计算其区别能力,进行验证;进一步在新冠肺炎疑 似患者中进行验证,以证明微生物基因区别模型弥补RT‑PCR的可能性。 8.一种用于区别新型冠状病毒感染和非感染者的肠道微生物模型的试剂盒,包括用于 检测权利要求1所述的SEQ  ID NO:1‑7所示的7种微生物基因的引物

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