分子力学方法.pptVIP

分子力学方法 第一页，共29页 二、分子力学方法的应用 本章主要内容 一、分子力学方法简介 分子力学方法 第二页，共29页 分子力学（Molecular Mechanics） ，又叫力场方法（force field method），目前广泛地用于计算分子的构象和能量。 1.1 何谓分子力学 分子力学从本质上说上是能量最小值方法，即在原子间相互作用势的作用下, 通过改变粒子分布的几何位型, 以能量最小为判据, 从而获得体系的最佳结构。 一、分子力学方法简介 分子力学方法 第三页，共29页 在分子内部，化学键都有“自然”的键长值和键角值。分子要调整它的几何形状（构象），以使其键长值和键角值尽可能接近自然值，同时也使非键作用（van der Waals力）处于最小的状态，给出原子核位置的最佳排布。 1.2 子的经典力学模型 - 1946，T.L.Hill T.L.Hill提出用van der Waals作用能和键长、键角的变形能来计算分子的能量，以优化分子的空间构型。 分子内部的空间作用是众所周知的：1）基团或原子之间靠近时则相互排斥； 2）为了减少这种作用，基团或原子就趋于相互离开，但是这将使键长伸长或键角发生弯曲，又引起了相应的能量升高。最后的构型将是这两种力折衷的结果，并且是能量最低的构型。 分子力学方法 第