高鹏_红麻核酮糖-1,5-二磷酸羧化酶生物信息学分析.pdfVIP

红麻核酮糖的生物信息学分析 目录 红麻核酮糖-1,5-二磷酸羧化酶的生物信息学分析 1 摘要1 Abstract1 1.引言1 1.1 核酮糖-1,5-二磷酸羧化酶的研究现状 2 1.2 红麻 2 1.3 生物信息学 3 1.4 电子克隆3 2.材料与方法 4 2.1 材料4 2.2 方法4 3.结果与分析5 3.1 多重序列比对5 3.2 模式搜索7 3.3 疏水性分析 3.4 大亚基的物理化学性质 9 3.5 序列搜索 PDBsum10 3.6 建筑设计概论12 3.7 二级结构：4hhh 3.8 大单元拓扑:4hhh 3.9 Quick2D 3.10 同源性建模 3.11 信号肽和亚细胞定位预测 4. 结论 12 参考文献13 致谢14 1 红麻核酮糖的生物信息学分析 红麻核酮糖-1,5-二磷酸羧化酶的生物信息学分析 摘要 通过电子克隆技术对红麻核酮糖-1,5-二磷酸羧化酶进行预测和生物学信息 学分析。结果表明：红麻核酮糖-1,5-二磷酸羧化酶序列包含一个 2202 bp 的开放 阅读框，编码477 个氨基酸；为亲水性蛋白，不存在信号肽；蛋白的结构主要为 α- 螺旋、无规则卷曲和延伸链；存在 35 个丝氨酸（Ser）、27 个苏氨酸（Thr ）、11 个酪氨酸（Tyr ），可能成为磷酸化位点。结果可为红麻核酮糖-1,5-二磷酸羧化 酶的实验克隆、功能鉴定及其应用提供参考。 关键词：红麻,核酮糖-1,5-二磷酸羧化酶，电子克隆，生物信息学 Abstract The electronic cloning technology was used to predict and analyze the biological information of kenaf ribulose -1,5- bisphosphate carboxylase. The results showed that the sequence of rubulose-1, 5-bisphosphate carboxylase in kenaf contained an open 2 红麻核酮糖的生物信息学分析 reading frame of 2202 bp, encoding 477 amino acids. Hydrophilic protein, no signal peptide; The structure of the protein was mainly leben-helix, irregular winding and extension chain. There are 35 serine (Ser), 27 threonine (Thr) and 11 tyrosine (Tyr), which may become phosphorylation sites. The results can provide reference for the experimental cloning, functional identification and application of rubulose-1, 5- bisphosphate carboxylase in kenaf. Key words: kenaf, ribulose -1, 5-bisphosphate carboxylase, electron