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DNA结合域 螺旋-转角-螺旋(HTH)结构基序 锌指(ZF)结构基序 螺旋-突环-螺旋(HLH)结构基序 亮氨酸拉链(LZ)结构基序 螺旋-转角-螺旋(Helix-turn-helix) 最常见的一种基序,基序包含有两个a螺旋,螺旋之间间隔有一个短的b转角,使两个螺旋可通过疏水作用装配起来。第一个螺旋稳定并使第二个螺旋暴露出来,与DNA的大沟作用,而特异性地与碱基接触。因此,第二个螺旋被称为识别螺旋(recognition helix)。上述的相互作用锚定了蛋白质中识别螺旋的位置并稳定了DNA的构象,从而调节不同蛋白和其结合位点的亲和力。 螺旋-转角-螺旋(HTH) 蛋白质能识别DNA,主要是靠着蛋白质氨基酸侧链与DNA的碱基之间形成氢键以及疏水性作用来完成;识别时不必打开双螺旋。 红色部分为识别螺旋,蓝色部分则起帮助识别螺旋定位到DNA大沟上的作用。 图 果蝇通过在卵泡细胞中选择性扩增来满足在短期中对卵壳蛋白的大量需要 染色体的扩增 染色体的扩增其本质是指细胞内特定基困拷贝数专一性大量增加的现象。 组织中整个染色体组都进行扩增 发育中的编程扩增 哺乳动物培养细胞中定向基因的应激性扩增 图 免疫球蛋白由两条重链和两条轻链由二硫键连接构成了Y型的对称结构 染色体基因的重排 免疫球蛋白在成熟过程中的重排 编码基因: Lκ、Lλ:L+V+J+C H: L+V+D+J+C L:前导片段 V:可变片段 J:连接片段 C:恒定片段 D:多样性片段 第一次重排发生在前B细胞中,最先由编码免疫球蛋白重链的基因族片段参与重排,使在种系中相互分离的片段经重排后连接在一起,称为V—D—J连接。其间,D片段与J片段先连接,接着v片段加到D—J上,形成V—D—J复合体。重排中选择的片段是随机的,片段之间序列在重排中被删除。重链重排后接着是轻链κ链基因重排,形成V—J复合体。重排后的重链、轻链转录成初始转录产物mRNA,经加工、剪接,形成成熟的umRNA,并翻译成免疫球蛋白IgM。只有κ链基因重排失败,才发动λ链基因重排,故抗体中大部分轻链是κ 链, λ 链只占少部分。淋巴细胞在繁殖过程中还发生体细胞突变.以增加抗体的多样性。 等位基因排斥:只有一个等位基因重排 同型型排斥: κ 链、 λ 链只有一个重排 重排的本质:位点特异性重组 在v片段的下游,J片段的上游以及D片段的两侧均存在保守的重组信号序列,该信号有一个共同的7bp的回文序列和一个富含A的9bp序列,中间固定长度为12bp或23bp,也是一种识别信号,重组只发生在间隔12bp和间隔23bp序列之间,称为12-23规则。H链V片段间隔为23bp,D片段间隔为12bp,J片段的间隔为23bp,7bp的回文序列总玉基因相连 第二次重排发生在成熟B细胞经抗原刺激后,这次重排出现重链基因改变恒定区,即类型转换,其抗原特异性不变。B细胞分化至此称为浆细胞,它的特点是可以大量分泌抗体,并且是单特异性的抗体。重链基因C片段的转换发生在转换区(S区),该区位于C片段的5’端,S区内存在成串的重复序列,转换即Sμ与各S位点间的重组。Cδ片段前无S区,故IgM与IgD通常都共表达。 第三节 DNA水平上的调控 ☆ DNA的甲基化 ☆ DNA甲基化与转录抑制 ☆ 甲基化影响DNA与蛋白质的相互作用 DNA甲基化 真核生物DNA双螺旋中,胞嘧啶核苷的嘧啶环5位甲基化,并与其上的鸟嘌呤形成mCpG是DNA甲基化的唯一形式,在高等生物体内转录与不转录的细胞中差别可达106倍。 主要决定于甲基化CpG的密度和启动子强度两个因素。 DNA及组蛋白的甲基化是非活性状态的染色质的特征。 CpG岛(CpG island) 哺乳动物基因组中,富含未甲基化的CpG的区域,通常长1~2kb,称为CpG岛。 位于组成型表达基因的启动子附近的CpG岛通常未甲基化 偶尔在一些组织特异性表达的基因的启动子附近也能发现CpG岛 人类基因组中约有29,000个CpG岛 CpG岛的甲基化可抑制启动子的活性。 蛋白质结合到甲基化的CpG后基因表达就会受到抑制。 富含CpG岛的区域,其密度甚至可达到10/100 bp。图中每个垂直线代表一个CpG doublet. DNA中多数甲基化的基团是位于两条链的CpG的C上。 甲基化状态主要由三种酶控制。 De novo methylase(重新甲基化酶)和perpetuation methylase(维持性甲基化酶)已知,但Demethylase(脱甲基酶)还未被鉴定。 DNA甲基化与
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