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- 2022-04-03 发布于河南
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生物统计学
一、课程简介
《生物统计学》是生物技术本科专业的一门理论性和实用性都较强的专业基础课,是学生在学习了数学分析、线性代数和概率论与数理统计等课程,以及部分生物基础课程后开设的一门课程。本门课程主要讲解在生物学,尤其是生物信息学中应用较多的统计学原理和方法,其主要目的是培养学生具有科学试验设计的能力和对试验资料进行统计分析处理的能力。生物统计学课程也是后续高等多元统计和统计遗传学课程的基础。课程主要任务是培养学生初步掌握基本的生物统计的原理与方法;培养学生掌握常用的实验设计方法和统计分析;培养学生掌握生物统计基本理论、基本技术和常用方法,能够用生物统计方法和技术对试验资料进行正确的统计分析;培养学生掌握必要的计算机统计分析技术,能够采用合理方法对数据进行统计分析。
二、理论教学内容
统计描述
掌握内容:连续型数据和离散型数据频数分布表的制作方法;计量和分类资料数据的平均数、标准差、偏斜度和峭度,以及变异系数的计算方法和应用;条图、圆图、百分条图、线图、直方图、散点图和盒式图的绘制方法。
了解内容:几个常用的统计术语,及样本与总体的关系。
t检验
掌握内容:单样本t检验、配对样本t检验和独立样本t检验的基本原理和他们之间的区别;两样本方差齐性检验和两总体方差不相等时的均值比较t检验。基于基因芯片数据应用t检验寻找差异表达基因。
拟合优度检验
掌握内容:检验的意义、原理与基本步骤;拟合优度检验的一般原理;独立性检验。了解内容:精确Fisher检验的方法。
方差分析
掌握内容:方差分析的意义、基本原理和基本步骤;单因素方差分析的基本原理;单因素方差分析的基本方法和步骤;多重比较的基本原理和方法;Permutation方法和多重检验校正。方差分析中数据转换的方法,固定效应模型、随机效应模型。
了解内容:方差分析的数学模型与期望均方,方差分析应具备的条件。
两因素及多因素方差分析。
掌握内容:两因素固定模型,两因素随机模型、两因素混合模型。两个以上因素的方差分析。缺失数据的估计。
了解内容:两因素方差分析中的一些基本概念。
一元回归及简单相关分析
掌握内容:一元线性回归分析的步骤与方法,一元线性回归分析的显著性检验的方法。简单相关分析的概念。
了解内容:一元非线性回归。
多元回归及复相关分析
掌握内容:多元线性回归分析的意义及多元线性回归方程的建立方法,多元线性回归关系的显著性检验方法,偏回归系数的显著性检验方法。多元线性回归分析的应用。
了解内容:复相关分析,逐步回归分析。
三、实验教学内容
t检验和拟合优度检验
基本内容:利用R语言对数据进行t检验,拟合优度检验。
基本要求:能够利用R语言进行t检验(差异表达基因的筛选),会判断样本是否满足正态性和方差齐性。
回归和相关分析
基本内容:一元线性回归的基本思想和方法,多元线性回归的基本思想和方法,非线性回归到基本思想和方法,它们之间的区别和联系,各自的应用范围,回归分析用计算机软件(R)的具体实现以及对分析结果的解释。
基本要求:掌握利用计算机软件(R)进行一元及多元的线性回归,进行简单相关分析,并能够对结果进行科学的统计学解释(基于表达谱数据分析表达与高血压之间的回归关系)。
方差分析
基本内容:单因素方差分析的分类(固定模型和随机模型),各自的应用范围,他们之间的区别于联系,用计算机软件(R)的具体实现以及分析结果的解释。两因素方差分析的分类(固定模型、随机模型和混合模型),各自的应用范围,他们之间的区别于联系,多因素方差分析,用计算机软件(R)的具体实现以及分析结果的解释。
基本要求:掌握利用计算机软件(R)进行单因素固定模型和随机模型的方差分析、两因素和多因素方差分析并能够都结果进行科学的统计学解释。
四、参考资料
参考书
《生物统计学》第三版.杜荣骞主编.高等教育出版社.2009年出版
《生物统计附试验设计》第二版.贵州农学院主编.农业出版社.1989年出版
《生物统计学》第一版.李喜春等主编.科学出版社.2008年出版
《生物统计学》李春喜,姜丽娜,邵云,张黛静.科学出版社.2017年07月
序号教学内容参考学时总学时理论学时实验学时1统计描述4402t 检验6
序号
教学内容
参考学时
总学时
理论学时
实验学时
1
统计描述
4
4
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2
t 检验
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4
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拟合优度检验
8
6
2
4
方差分析
10
8
2
5
两因素及多因素方差分析
8
6
2
6
简单线性回归
8
6
2
7
多元回归及复相关分析
6
4
2
合计
50
38
12
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