《分子组学基础》教学大纲（本科）.docxVIP

PAGE PAGE 37 分子组学基础 一、课程简介 《分子组学基础》是生物技术专业的专业基础课程。通过本课程的学习，让学生系统的认识人类及其相关物种，特别是细菌、病毒等重要的病原微生物基因组的全貌、共性及差异化特征，了解基因组相关的修饰（表观组、变异组）、产物（转录组、蛋白质组、酶和受体组）等重要的组学分子类型的作用方式及其对表型和疾病形成过程的影响。本门课程是生物医学工程专业学生后续的生物信息学类、系统生物学类和药物组学分析类课程学习的基础，将为学生进一步学习基于基因组及其衍生的各种组学大数据信息开展药物设计和研发提供必要的知识储备。 二、理论教学内容 基因组 掌握内容：真核生物染色体、原核生物染色体特征；人类基因组，其他生物基因组。 了解内容：DNA的化学组成、功能特性；RNA的结构、修饰与功能；蛋白质的结构与功能；中心法则；DNA的构型与功能；基因组的序列组成；基因的组成；C值与C值悖论；蛋白质的多样性；大分子序列的复杂性；基因家族的概念；假基因；异常结构基因。 遗传图绘制 掌握内容：遗传作图和物理作图的概念；常用的DNA标记和特点连锁不平衡的概念；重组率的计算方法；不同的遗传作图方法；人类遗传作图；其他（水稻）遗传作图情况。 了解内容：孟德尔遗传学的概念；连锁分析的概念和特征；常用数据库搜索工具的参数的意义。 物理图绘制 掌握内容：限制性作图的原理；限制性作图的方法和局限；基于克隆的基因组作图流程；人类基因组和水稻基因组整合图的基本情况；重叠群的概念。 了解内容：大分子DNA的克隆载体构建和相关概念；指纹作图的相关概念；原位染色体连锁图的绘制方法；辐射杂种作图的技术原理、程序与方法；表达序列标签的概念。 基因组测序与序列组装 掌握内容：链终止法和化学降解法的概念和技术原理；第二代测序技术的原理、特点和关键技术指标；基因组测序的基本策略；读序的概念；序列组装中的重要术语。 了解内容：第一代DNA测序技术的特点、操作流程和相关概念；第二代测序技术的发展状况；第三代测序技术的关键技术流程和相关概念；测序覆盖度的概念；序列间隙与物理间隙的概念；不同测序方法的序列组织技术流程。 基因组序列注释 掌握内容：基因的注释流程；计算机预测基因功能的一般思路；基因功能检测的常用技术；基于进化的基因功能注释方法。 了解内容：基因搜寻相关的关键概念；基因的命名和分类原则；同源基因的概念和查找思路；基因注释软件；基因确认的实验方法；蛋白质结构域与基因功能注释；功能基因组学的概念；功能基因组学研究的范畴和重要的技术领域；基因本体的概念。 基因组解剖 掌握内容：原核生物基因组的物理结构及相关概念；原核生物基因组的遗传组成；真核生物基因组的物理结构及相关概念；真核生物细胞器基因组；人类基因组的结构与组成；拟南芥基因组的结构与组成。 了解内容：DNA转座子的概念；逆转录因子与分散重复序列家族的概念；串联重复序列的概念及其分布。 基因的转录调控与转录物组 掌握内容：非编码RNA的种类和概念；长非编码RNA的概念及生物学意义。 了解内容：原核生物基因的转录过程及相关概念；真核生物基因的转录过程及相关概念；转录因子的概念、分类及其作用方式；细胞中的转录物组分；mRNA的概念和特征；mRNA前体剪接加工的研究进展；mRNA的定位与降解；mRNA的修饰过程；基因组非编码RNA的发现与功能。 蛋白质组 掌握内容：翻译的整体调控；翻译的专一性调控；蛋白质的剪切加工；蛋白质折叠；蛋白质降解标记—泛素化；蛋白酶体；蛋白质降解的生物学意义。 了解内容：密码子与反密码子互作；tRNA酰胺化过程；蛋白质合成中核糖体的作用；蛋白质翻译后化学修饰。 基因组表观遗传 掌握内容：绝缘子的概念；位置效应与表观遗传；副突变；单等位基因表达；表观遗传通路的概念和意义（诱导、起始、维持）；表观遗传密码。 了解内容：表观遗传学的概念与研究范畴；表观遗传的机制；表观遗传学的与表型关联性； DNA甲基化的概念与机制；DNA甲基因化的调控作用；基因组印记的概念；核小体修饰与基因表达；染色质重建的两个模型；表观遗传现象和研究进展。 基因组的复制 掌握内容：DNA复制的拓扑学；DNA拓扑酶及其功能；复制的起始点；复制的起始、延伸、终止等过程；古细菌基因组的复制；酵母DNA复制起始点；高等真核生物DNA复制起始点；真核生物复制叉上的事件；端粒复制；基因组复制与细胞的分裂；细胞S期的调控。 了解内容：半保守复制；复制的特点；叶绿体基因组的复制；线粒体基因组的复制。 基因组进化的分子基础 掌握内容：同源重组；位点专一性重组；双链断裂重组模型；DNA转座；逆转录转座。 了解内容：突变的机制与效应；DNA修复机制；超突变与程序性突变；染色体重排；DNA 单链的非对称性进化。 基因组与生物进化 掌握内容：基