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基因组DNA甲基化及组蛋白甲基化 王瑞娴 基因组dna甲基化及组蛋白甲基化王瑞娴 基因组DNA甲基化和组蛋白甲基化lowbar；王瑞贤 基因组dna甲基化及组蛋白甲基化 王瑞贤、徐建红 浙江大学农业与生物技术学院,杭州310058 摘要：DNA甲基化是真核生物中一个非常重要的表观遗传学标记，它可以影响染色质的结构和基因的表达。随着 着全基因组甲基化测序的发展,全基因组范围内的dna甲基化水平得以了解。文章概述了基因组中启动子、基因本体、增强子、沉默子和转座子等不同元件的dna甲基化的研究进展,以及dna甲基化与基因表达调控间的关系。启动子的dna甲基化对基因的表达有抑制作用,而基因本体的dna甲基化与基因的表达关系因物种或细胞类型不同而异。增强子的dna甲基化状态与基因活性呈反比关系,沉默子则相反呈正相关。转座子的dna高度甲基化抑制其转座活性,从而维持基因组的稳定性。文章还探讨了dna甲基化与组蛋白甲基化间的相互作用及其对基因表达、可变剪切、转录的调控作用,以及本领域的未来研究方向。 关键词：甲基化；中央人民政府岛；基因本体论；组蛋白 genomicdnamethylationandhistonemethylation 瑞贤旺，徐建宏 collegeofagricultureandbiotechnology,zhejianguniversity,hangzhou310058,china 摘要：DNA甲基化是真核生物中重要的基因标记物，并可能影响染色指示和基因表达。随着基因组全甲基化测序技术的发展，可以评估整个基因组中的DNA甲基化水平。本文综述了DNA甲基化启动子、基因体、增强子、沉默子和转座子的研究进展，以及DNA甲基化和基因表达之间的关系。DNA甲基化基因启动子抑制基因表达，而基因的名称甲基化和基因表达之间的关系取决于物种和细胞类型。基因活性与癌症的名称甲基化水平呈负相关，但与癌症的名称甲基化呈正相关。转座子的高甲基化限制了转座子的定位活性，以维持基因稳定性。此外，我们还讨论了名称甲基化和组织甲基化之间的相互作用、其在基因表达调控中的作用、选择性表达和转录以及该领域未来研究的方向。 keywords:methylation;cpgisland;genebody;histone 收到：2022? 10? 28; 修理日期：2022? 12? 05 基金项目:国家自然科学基金项目(编号和人事厅留学回国基金(编号：资助 通讯作者：徐建宏，博士，研究员，研究方向：基因组学和分子生物学。电邮：jhxu@zju.edu.cndoi：10.3724/sp.j.1005.2022.0191 192hereditas(beijing)2021 早在1975年，Holliday和Riggs[1,2]就发现在脊椎动物中，CpG位点的胞嘧啶甲基化可以用作遗传标记，这种甲基化可以通过体细胞分裂遗传。胞嘧啶残基第5个碳原子的甲基化是植物和哺乳动物中研究最广泛的表观遗传修饰。在哺乳动物中，胞嘧啶甲基化主要存在于CG序列中；除了植物中的CG甲基化外，还有CHG和CHH（H=a、C或T）的甲基化。拟南芥中CG、CHG和CHH的甲基化程度分别为24%、6.7%和1.7%[3]。 dna甲基化功能的本质是甲基化机制的建立、维持和去除甲基。dna甲基转移酶(dnamethy-ltransferase,dnmt)在调节基因甲基化过程中起着重要作用。在哺乳动物中dnmt有dnmt1、dnmt2和dnmt3三种[4],其中dnmt3分为dnmt3a和dnmt3b,参与dna的重新甲基化过程[5],是发育早期dna甲基化必不可少的。目前,普遍认为dnmt3a对dna甲基化的保持是必需的[6]。在拟南芥中,存在两种从头开始的dna甲基化酶methyltran-sferase(met1)和chromomethylase(cmt3),met1是dnmt1甲基化酶的同系物,催化cg位点甲基化,而cmt3是一个植物特异性的甲基化酶,催化chg位点的甲基化。不对称的chh位点的甲基化则由cmt3和domainsrearrangedmethyltransferase2(drm2)共同催化,在这个过程中可能涉及到一些sirna(smallinterferingrnas)或信号分子的作用[7,8](图1)。 DNA甲基化相对稳定，在DNA复制过程中可以稳定存在。这一特性在转座子诱导突变和染色体畸变等植物防御过程中起着非常重要的作用。随着全基因组甲基化测序技术的发展，DNA甲基化的位置及其与