第八章真核基因表达调控.pptx

第八章真核基因表达调控;一、真核基因组结构特点;● 基因组特别小,大多只有一条染色体 ● 结构简炼 ● 存在转录单元多顺反子;三、基本概念;1、简单多基因家族 简单多基因家族中的基因一般以串联方式前后相连。;The eukaryotic ribosomal DNA repeating unit;2、复杂多基因家族;Organization of histone genes in the animal genome;发育调控的复杂多基因家族: 血红蛋白基因家族;(二)断裂基因;;1、外显子与内含子的连接区;有些DNA序列可编码一条以上的蛋白质;2、外显子与内含子的可变调控;(三)假基因;第二节 真核生物基因表达调控的特点和种类;依照其性质可分为两大类:;第三节 真核生物DNA水平上的基因表达调控;一、基因丢失:;二、基因扩增:;基因组拷贝数增加,即多倍性,在植物中是特别普遍的现象。基因组拷贝数增加使可供遗传重组的物质增多,这估计构成了加速基因进化、基因组重组和最终物种形成的一种方式。 小麦、大豆都是多倍体植物。;将一个基因从远离启动子的地方移到距它特别近的位点从而启动转录,这种方式被称为基因重排。 通过基因重排调节基因活性的典型例子是免疫球蛋白结构基因的表达。;;;免疫球蛋白由两条重链(可变区V、连接区J、恒定区C)和两条轻链(V、C)组成;;淋巴细胞 ;实例二:人类血红蛋白;;四、DNA甲基化与基因活性的调控;;在真核生物中,5-甲基胞嘧啶主要出现在CpG序列、CpXpG、CCA/TGG和GATC中 ;真核生物细胞内存在两种甲基化酶活性:;;2、DNA甲基化抑制基因转录的机理;DNA甲基化对基因转录的抑制作用P252;DNA的甲基化提高了位点突变频率;DNA的甲基化与X染色体失活;Xist;五、染色质结构与基因表达调控:;真核细胞中基因转录的模板是染色质而不是裸露的DNA,因此染色质呈疏松或紧密结构,即是否处于活化状态是决定RNA聚合酶能否有效行使转录功能的关键。;活性染色质的主要特点;活性染色体结构变化;DNaseⅠ hypersensitive sites;HMG 蛋白质是真核细胞核内一组含量丰富的非组蛋白, 它们在染色质的结构与功能及基因表达调控过程中均起着重要作用。;2、 DNA拓扑结构变化;4、 组蛋白变化;活性染色质上具有DNase I超敏感位点。每个活跃表达的基因都有一个或几个超敏感位点,大部分位于基因5′端启动子区域。;活性染色质上具有核基质结合区( matrix attachment region,MAR)。MAR一般位于DNA放射环或活性转录基因的两端。在外源基因两端接上MAR,可增加基因表达水平10倍以上,说明MAR在基因表达调控中有作用, 是一种新的基因调控元件。;第四节 真核生物转录水平上的基因表达调控;主要讨论真核RNA聚合酶II;“基因”的分子生物学定义:产生一条多肽链或功能RNA所必需的全部核苷酸序列。;(二)顺式作用元件 定义:影响自身基因表达活性的非编码DNA序列。 例: 启动子、增强子、沉默子等;; 增强子;增强子及其功能;增强子的其它特性:;A gene enhancer element can function in gene regulation at a distance、 ;增强子作用机理: ;第三节 反式作用因子(转录因子)对转录的影响;一、转录因子的类型;一、转录因子的类型;;TF Ⅱ D的一个亚基是特异识别TATA框的,称为TATA框结合蛋白(TBP);其余亚基叫TBP-相关因子(TAF); 起始复合物的组装过程: TF Ⅱ D(TBP、TAFs)+DNA+ TF Ⅱ A+ TF Ⅱ B+ (TF Ⅱ F+ RNA pol Ⅱ )+ TF Ⅱ E;RNA pol Ⅱ的上游元件及其转录因子;二、转录因子的DNA结合结构域;Three major categories of transcription factor protein;1、锌指:;大部分的锌指区都聚合成一组,但也有的不止一个锌指簇,一般认为,假如某个蛋白具有一个或多个成簇的锌指区,那么它特别估计就是转录因子。;锌指区结构都是以锌将一个α 螺旋与一个反向平行的β折叠片的基底通过半胱氨酸和组氨酸之间形成配位键连接起来,指环上的赖氨酸和精氨酸参与DNA的结合 结合在DNA大沟中重复出现,因此结合牢固。;糖皮质激素特异性;2、碱性亮氨酸“拉链”式二聚体bZIP;这些?-螺旋的一个突出特点是频繁出现亮氨酸,同时趋于每7个氨基酸残基出现一个亮氨酸,这种出现频率使得在形成?-螺旋时,亮氨酸出现在?-螺旋的疏水一侧,同时直线排列。 早期设想的这些?-螺旋之间的蛋白质—蛋白质相互作用的模式是亮氨酸残基