mNGS高通量测序分享.pptxVIP

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  • 2023-01-04 发布于四川
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mNGS高通量测序mNGS测序简介病原微生物检测流程原理简介应用及特点01mNGS测序简介方法学介绍点击添加文字“mNGS(Metagenomic next-generation sequencing)不依赖于传统的微生物培养,直接对临床样本中的核酸进行高通量测序,能够快速、客观的检测临床样本中的多种病原微生物(包括病毒、细菌、真菌、寄生虫),尤其适用于急危重症和疑难感染的诊断。Your Business Slogan Here方法学对比点击编辑标题点击编辑标题您的内容打在这里,或者通过复制您的文本,在此框中选择粘贴。您的内容打在这里,或者通过复制您的文本,在此框中选择粘贴。方法学对比传统的方法学:1、检测周期漫长2、检测靶标单一3、经验猜测困难4、培养检出率低点击添加文字Your Business Slogan Here方法学对比点击添加文字 mNGS检测:1、快速鉴定2、无需覆盖3、无需预设4、无需培养Your Business Slogan Here主要适应症点击编辑标题点击编辑标题您的内容打在这里,或者通过复制您的文本,在此框中选择粘贴。您的内容打在这里,或者通过复制您的文本,在此框中选择粘贴。◆病情危重,需要尽快明确病原体◆特殊病人,如免疫抑制宿主、合并基础疾病、反复住院的重症感染患者◆特殊病原体或疑似特殊病原体感染◆传统微生物检测技术反复阴性且治疗效果不佳的感染性疾病◆新发病原体,临床上提示可能有一定的传染性◆病因不明,长期发热和/或伴有其他临床症状02病原微生物检测流程病原微生物实验室检测流程咨询与知情同意、申请直接联系已知的检测单位,联系相关人员了解检测详情点击添加文字根据感染部位,临床症状等判断所查项目网络搜索,线上联系了解检测详情Your Business Slogan Here医院医生推荐相关机构进行检测样本采集点击编辑标题点击编辑标题您的内容打在这里,或者通过复制您的文本,在此框中选择粘贴。您的内容打在这里,或者通过复制您的文本,在此框中选择粘贴。标本采集指导原则◆尽量在抗菌药物使用前采集标本◆尽量采集感染病灶部位标本◆从无菌部位采集的标本更具有诊断价值◆标本采集过程中应严格执行无菌操作◆标本的标签和申请单信息需要填写完整样本寄送、接收登记点击添加文字按照样本运输条件进行运输,全血样本不可冷冻运输,可将样本包裹后与冰袋或者干冰不直接接触,其它样本可冷冻运输收取样本时做好保护措施,对于感染样本需要灭活处理Lis系统登记样本信息,核实样本申请单信息Your Business Slogan Here样本前处理静脉血离心后取血清或血浆加入裂解试剂适宜温度条件下孵育核酸释放60℃ 30min灭活液化肺泡灌洗液痰液粘稠不粘稠脑脊液离心后留沉淀胸水腹水尿液穿刺组织核酸提取柱膜法:纯度优磁珠法:浓度优点击添加文字Your Business Slogan Here核酸扩增、文库构建浓度及纯度较好的DNA/RNA核酸50ng,OD值1.7-2.0快速建库试剂盒LSK109 PCR产物建库试剂盒SQK-PBK004击字特定引物扩增随机扩增三代文库构建二代文库构建Ampliseq文库构建模块rness Slogan Here核酸质检Nanodorp分光光度计Qubit 荧光定量仪电泳仪Your Business Slogan Here核酸、文库质检点击添加文字毛细血管电泳仪荧光定量PCR仪毛细血管电泳仪Your Business Slogan Here上机-二代点击添加文字5-7小时1小时Your Business Slogan Here2-3小时12小时二代数据输出点击编辑标题点击编辑标题您的内容打在这里,或者通过复制您的文本,在此框中选择粘贴。您的内容打在这里,或者通过复制您的文本,在此框中选择粘贴。上机-三代点击添加文字芯片初始化: 第一次使用前需要做芯片质检,800个孔是合格的指标; 每张芯片不是固定的孔数,是随机的; 再次使用前也需要做初始化。Your Business Slogan Here三代上机样本孔废液孔点击编辑标题点击编辑标题您的内容打在这里,或者通过复制您的文本,在此框中选择粘贴。您的内容打在这里,或者通过复制您的文本,在此框中选择粘贴。试剂孔三代数据输出点击编辑标题点击编辑标题您的内容打在这里,或者通过复制您的文本,在此框中选择粘贴。您的内容打在这里,或者通过复制您的文本,在此框中选择粘贴。03原理简介核酸提取滤芯法提取核酸Your Business Slogan Here聚合酶链式反应点击添加文字You

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