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第三十页，共七十页。 生物計算機--一個以蛋白質為基礎的菌化視網膜紫質3D光學記憶體 菌化紫質是在細菌的脂質細胞上所發現的紫色蛋白質鹽水暈細菌，生長在極度塩化的環境，在高溫且近厭性的狀態。 菌視紫質是一個相當難纏的蛋白質。例如，就算在溫度高達140°C的乾燥環境，暴露在空氣中或陽光下數年不受影響，它可以忍受PH值0-12或是高濃度塩化(3M)狀態，甚至可以加在塑膠中，依舊不受影響。不是所有生物製造的東西都是很脆弱的。 細菌利用它將光線轉換成電能跟化學能。 第三十一页，共七十页。 細菌紫質在光線驅動的蛋白質，當它吸收光線時，它將一個質子運送送過細胞璧。這轉運造成質子的不平衡，或稱梯度差，這些質子梯度現在被ATPase蛋白質加以利用，像一個小型的太陽能細胞。 可做唯一個超快速雙向穩定，製造三維光學記憶的紅綠開關。 綠色雷射光驅動菌視紫質從地面狀態轉換成啟動狀態，稱為Q狀態。 紅色雷射光驅動從O狀態到中介的P狀態，再到穩定的Q狀態。 第三十二页，共七十页。 利用這兩種雷射，我們可以將菌視紫質從一穩定狀態驅動到另一穩定狀態。這兩種雷射(綠和紅)放在這立方塊的正確角度上，我們可以在這三維空間中的立方塊內任何一處寫入資訊。 以低密度的雷射讀出原本存放的資料，所以它將不會有轉換。 發出非常低密度的紅光雷射穿過菌視紫質，這區域中如果在O狀態的，將會吸收紅光，而如果這些區域是在Q狀態的將會允許紅光穿過它。然後就可以用高密度的光感測器讀出。 這種記憶體至少有三種好處。首先，這讀與寫的操作可以視平行達成的。第二，這是屬於光學的技術，而光子比電子快上許多。第三，因為這記憶體是第三度空間的，每一立方公分1011 到1013bit，將這跟二維的光學記憶加以比較的話，是每一立方公分108 bits。 第三十三页，共七十页。 第三十四页，共七十页。 第三十五页，共七十页。 離子通道如同感測器 脂質膜對水合離子是絕佳的絕緣體，譬如鈉離子和氯離子。這需離子通道可被想像成一個神聖的管子，它允許離子經由它的洞穿過。這離子通道的開啟與關閉來自外來的刺激。 若化合物和管口結合，它可能就會很簡單的擋住了通道，所以離子就不能通過。 離子的穿透，利用電流的流進與流出測出，在每一秒裡可以有一個到一千萬個鈉離子穿過離子通道。如同百萬個電子穿過銅導線。 第三十六页，共七十页。 第三十七页，共七十页。 最聰明的是離子通道可以當成一個化學放大器。 量測單一離子的通道流過的離子數是可能達成的。 電流流過單一離子通道是典型上都是以nano，到pico安培的範圍(10-9-10-12安培)，在它是開啟的狀態。如有一分子這時擋住了離子通道，它的電流會降為零。 離子通道傳導可能被大量的機制所控制，離子通道可能因一個電位差的存在而開啟與關閉，就像神經細胞一般。 第三十八页，共七十页。 製作一個實驗的化學感測器，一個通用的分子認定元素是必須的。 抗體是Y型的蛋白質，是身體免疫系統防禦的第一線。如果有一個外來的分子進入了體內，它就會產生抗體，並且結合外來的分子。一旦這些抗體連接以後，其他在體內的防禦機制，就會接手去消滅這些侵入者。 抗體可以以現代生物的方法來製造。 第二件所需的事情是一個隔離用的脂質膜，更好的是可以貼在一個電極上。感應器連接產生感應電子並可以讀出的元件。 第三十九页，共七十页。 在一個有脂質膜粘著固體電極的感應元件中，介於電極和脂質膜必須提供一個離子儲液蘘。 第三件所需的是必須擁有一個普通的感應機制，以抗體去結合特別的解析器，簡單、耐用的離子通道可以被發現或者發展出來。 第四、這些電機工程中的感應電極必須可以正確的連接世界上其它的電子儀器。 短桿菌素是一個有關小型離子通道，是由兩個多氨酸管所組成。 第四十页，共七十页。 短桿菌素能夠很自由的並且很獨立的擴散通過內層及一半外層的脂質膜，陽離子只能夠流過膜兩半的整為一線，所以一個穿過細胞膜連續的洞就行成了。當他們沒有形成一線，沒有離子流動。 這兩個離子通道的閘門，經由六個氫鍵的行成，排成一列。他們約在0.1到1秒之間。 控制它的開關，經由植入一個一半的短桿菌素在電極表面，此時它不能移動，另一半是放進膜的外圍小葉並連接一個抗體受器群。 第四十一页，共七十页。 另一個抗體在一些距離上是不能移動的，適用一個特別的綜合膜擴展脂層，那些抗體所有的方法可以連向金質電極的表面。 另一個解析分子，這是黏貼在膜擴展脂質層上的。一旦這一個短桿菌素結合住膜擴展質層經由抗體－解析器－抗體複合，它不在可以擴散也不可以形成離子通道經由內部的短桿菌素，一離子通道在反映任何一個解析器是永久的關閉。 TSH(一種賀爾蒙，促甲狀腺素)，它的離子傳導性通過離子通道就會隨著時間的增加而降低直到離子通道關閉為止。 設計這個感應器，4nm儲液曩在脂質層跟金質電極之間形成。儲液曩是由親