在水产养殖系统中哈维氏弧菌的分子识别,打字和跟踪：目前的方法和未来的前景【文献综述】.pdfVIP

水产养殖-卷 287，2009年 2月（1-10） 毕业论文文献综述 生物工程 在水产养殖系统中哈维氏弧菌的分子识别，打字和跟踪：目前的 方法和未来的前景 摘要 哈维氏弧菌对水产养殖业是一种有经济意义的病原体，也是用于和鉴定，识别，追踪哈维氏弧 菌的工具。因此，哈维有关人口的利益。 由于表型基因组的相似性和可塑性，传统的表型鉴定和分 型方法并不总是能够解决从与其密切相关的物种中得来的哈维氏弧菌。这次审查提供了分子生物学 方法的概述和评估，目前在分类学和流行病学研究中用于识别和鉴定哈维氏弧菌的相关物种； 并提出发展分子方法的前景和挑战，对于在复杂的样品中哈维氏弧菌的直接检测。 关键词： 弧菌 ，弧菌病，物种鉴定，分子分型，源追踪 内容 1.简介 2.哈维氏弧菌目前的鉴定和识别的方法 2.1.表型的方法 2.2.分子生物学方法 2.2.1.全基因组分析 2.2.2.标记基因分析 3.在水产养殖系统中哈维氏弧菌的直接检测前景 3.1.特定集群的检测方法 3.2.有毒基因的检测方法 4.结论 致谢 参考文献 1. 简介 哈维氏弧菌是一个氯化钠依赖的曲杆型塑造体，革兰氏阴性菌是由海洋环境中发现的 （农民等， 2005 年）。在E.N 哈维提出这类菌种后，最初将其形容成为哈维氏无色菌（约翰逊和舒克，1936）， 在生物体发光系统研究的先驱领域，把后来的物种归属于卢奇细菌属（亨德里等，1970）和贝内克 氏菌属（Reichelt 和鲍曼，1973），最终将其定义在弧菌属和其家族群属中（鲍曼等，1981）.模式 水产养殖-卷 287，2009年 2月（1-10） 菌株先前识别确认的种类弧菌属鲨鱼弧菌（Grimes 等，1985）和竹荚鱼弧菌（岩本等，1996）被确 定为此类菌种的各变量（V. harveyi）。哈维氏以分子基础研究为依据的专题论文中（彼得森等，1998； Gauger 和 Gomez-chiarri，2002；汤普森等，2002），哈维氏弧菌被发现存在于水生环境中非共生的 自由生活状态并作为海洋动物的正常菌群的一部分（Ruby 和莫林，1979）。然而，在哈维氏菌群（V. harveyi）中，哈维氏菌株已被认作为在海洋鱼类和甲壳类动物水产养殖中最重要的病原体（阿尔瓦 雷斯等，1998；张和奥斯汀，2000；普哈尔特等，2003；Zorrilla 等，2003），包括对虾类 （Suranyanto 和 Miriam,1986；Karunasagar 等 1994；Lavilla-Pitogo 等，1998），和龙虾（贾瓦等，1996；迪格 尔斯等，2000；伯恩等，2006）。哈维氏弧菌对软体动物（Pass 等，1987；Nishimori 等，1998）和 珊瑚（萨瑟兰等，2004）的感染也有报道。 90 年代以来，哈维氏菌群（V. harveyi）有关的感染对南美（阿尔瓦雷斯等，1998）的大规模 对虾养殖 造成了 严重的经 济损失 ，甚至 导致澳大 利亚（ Pizzuto 和赫斯 特， 1995）和亚洲 （Jiravanichpaisal 等，1994）的草虾和日本对虾在幼体阶段死亡率达100%的情况也时常遇到。因 此，在对虾类养殖中，这种疾病被描述为对虾弧菌病，对虾细菌性败血症，bolitas negricans （黑 牛杆菌？），发光弧菌或红腿病。对弧菌病的症状反应包括嗜睡，组织和附属器官坏死，生长缓慢， 幼体变态缓慢和身体畸形，生物发光 （虾在黑暗中发光），肌肉浑浊不透明，melanisation （黑化病？ 或者抑郁症？），空肠和厌食症（Karunasagaret 等，1994；罗伯逊等，1998）。然而，有时候其他 水产养殖品种的大规模死亡事件也和哈维氏弧菌有关系，包括新兴未开发的水产养殖行业（Bourne 等，2004）。病原体已经被证明难以杜绝和抗生素的广泛使用在农场导致耐药菌株的发展（Karunasa， 噶尔等，1994）。哈维氏弧菌和它的相关种群本身并不认为对人类有害，但它能把非霍乱弧菌的多 重抗药性转移到抗霍乱弧菌上，后者引起了1991 年的拉丁美洲霍乱大爆发。然而，也有报道人类中 感染哈维氏弧菌的例