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                On to the road to degradation: atherosclerosis and the proteasome
Background of ubiquitin-proteasome system (UPS).Structure, function, and regulation of UPS.Potential roles of UPS in atherosclerosis:The UPS in the initial stage of atherosclerosis.The UPS in the progression stage of atherosclerosis.The UPS in the complication stage of atherosclerosis.Proteasome inhibition-for better or worse in atherosclerosis?Introduction2
Legacy of UPS:1970s: 8.5KDa polypeptide;  “ubiquitous immunopoietic polypeptide, (UBIP)” .Background3
BackgroundAvram Hershko Aaron Ciechanover Irwin Rose The 2004 Nobel Prize in Chemistry “for the discovery of ubiquitin-mediated protein degradation.”4
Legacy of UPS:1971-80:  Avron Hershko, Aaran Ciechanover, Irwin Rose.Heat-stable polypeptide of ATP-dependent proteolytic system from reticulocytes. Reticulocyte crude extracts: fraction I :APF-1:ATP-dependent proteolysis factor 1→“ubiquitin”. (1979,1980,Hershko A and Ciechanover A.)Fraction II: (1) 450kDa: 26S proteasome; (2)E1-E3 conjugating enzymes. (1979,discovered by 3 scientists)Background5
Legacy of UPS:1971-80:  Avron Hershko, Aaran Ciechanover, Irwin Rose.1981-83: multistep ubiquitin-tagging hypothesis.BackgroundProposed sequence of events in the ubiquitin-protein ligase system.6
Structure of UPS7
Regulation of UPSOn the level of E3 enzymes .Recognition patterns:N-end rule: “Destabilizing” N-terminal amino (Free basic, bulky hydrophic, or uncharged, e.g. arginine and lysine).Protein phosphorylation and hydroxylation. e.g. IκB and HIF-1α.Position of ubiquitin lysine residue. K48 for protein degradation and K63 for protein modulation.Ubiquitin activity regulation:Glucocorticoids, thyroid hormones, cytokines8
Function of UPSKiss of deathWaster disposer9
Function of UPSFunctional classProtein substratesPositive cell  cycle regulatorsCyclin A,B,D,ENegative cell  cycle regulatorsCDK inhibitors: p19INK4d , P21WAF1/Cip1K4dPro-apoptotic moleculesp53, Bax, Bid, Caspase 3, caspase 7Anti-apoptotic mole
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