生物合成 的学习材料.pptxVIP

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生物合成 的学习材料; DNA复制的概念:以DNA为模板,以4种dNTP为原料,在DNA聚合酶的作用下合成与模板互补的DNA分子的过程。 DNA复制是在细胞分裂前进行的。DNA通过自我复制生成2个与原来分子完全相同的DNA分子,细胞分裂后分别进入两个子细胞中,这样就把遗传信息由亲代DNA分子传给子代DNA分子。 ;第3页/共111页;n1 dATP; DNA复制方式: 半保留复制(semiconservative replication)。DNA在复制时首先两条链之间的氢键断裂两条链分开,然后以每一条链分别做模板各自合成一条新的DNA链,这样新合成的子代DNA分子中一条链来自亲代DNA,另一条链是新合成的,这种复制方式为半保留复制。 ;DNA Replication is semiconservative Each DNA strand serves as template for the synthesis of a new strand, producing two new DNA molecules, each with one new strand and one old strand. This is semiconservative replication ; 第一节 参与DNA复制的主要酶类与蛋白因子 (DNA复制系统); 拓扑异构酶Ⅱ:又称为旋转酶(gyrase),由两个A亚基和两个B亚基组成,即A2B2。它能使DNA的两条链同时发生断裂和再连接,当它引入负超螺旋以消除复制叉前进带来的扭曲张力时,需要由ATP提供能量。两种拓扑异构酶在DNA复制、转录和重组中均发挥重要作用。 ; 解旋酶(Helicase,DnaB):也称为解链酶。在复制叉处在其它因子的参与下利用水解ATP将DNA双股链解开。 其它因子主要包括: DnaA,识别大肠杆菌复制原点OriC,启动解链过程;DnaC,帮助解链酶(DnaB)结合 每解开一对碱基,需要水解2分子ATP。解旋酶不只有一种,还有参与转录、DNA修复、DNA重组等过程的解旋酶。 ; 单链DNA结合蛋白(single strand binding protein, SSB protein):与解开的DNA单链结合,防止碱基对的重新结合。 大肠杆菌的SSB蛋白由4个相同亚基构成,其功能在于稳定解开的DNA单链,阻止DNA复性和保护单链部分不被核酸酶降解。原核生物的SSB蛋白与DNA的结合表现出明显的协同效应:当第一个分子结合后,其他分子与DNA的结合能力可提高103倍。因此一旦结合反应开始,即迅速扩展,直至全部单链DNA都被SSB蛋白覆盖。SSB蛋白可以重复利用 ;解旋酶; 引物酶(primase,DnaG):又称引发酶,一种特殊??RNA聚合酶,用于合成RNA引物。已知DNA聚合酶催化DNA片段的合成要求一段与模板互补、带有3-OH的DNA 或RNA片段作引物。E coli 是由dnaG 基因编码。 该酶分子量约为60 000,该酶单独存在时相当不活泼,只有与其他蛋白质相互作用结合成一个复合体时才有活性,这种复合体称为引发体(primosome)。合成的引物是长约5~10个核苷酸的RNA。一旦RNA引物合成,就可以由DNA聚合酶Ⅲ在它的3′-OH上继续催化DNA新链的合成。 ; DNA聚合酶(DNA polymerase)是以DNA为模板,催化底物(dNTP)合成DNA的酶类,普遍存在于生物体内。它们的作用方式基本相同,都需要dNTP、Mg2+、模板DNA和引物,在DNA模板指导下,催化底物加到引物的3′-OH上,形成3′,5′磷酸二酯键,由5′→3′方向延长DNA链,见下图 。引物是DNA合成所必需的。;大肠杆菌DNA聚合酶Ⅰ由一条分子量为101 000的单一多肽链组成,多肽链中含有一个锌原子。每个大肠杆菌细胞约有400个分子的DNA聚合酶Ⅰ。DNA聚合酶Ⅰ的功能如下: ① 5’→3’聚合酶活性,即当底物和模板存在时,DNA聚合酶Ⅰ可使脱氧核糖核苷酸逐个加到引物的3′-OH末端的多核苷酸链上,在37℃条件下,每分子DNA聚合酶Ⅰ每分钟可以催化大约1000个脱氧核苷酸的聚合; ② 5’→3’外切酶活性,它可以及时切除复制起始合成的RNA引物; ③ 3’→5’外切酶活性,起校对功能,它可以切除聚合上去的错误核苷酸,从而可使复制的忠实性提高1 000倍。 DNA聚合酶Ⅰ可以被蛋白酶切成2个片段,大片段(68 000)称为Klenow,具有5′→3′聚合酶活性和3′→5′外切酶活性,是分子生物学研究中常用的工具酶。小片段(35 000)具有5′→3′外切酶活性,可以切除少量

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