基因组学功能基因组学蛋白质组学.ppt

基因组学功能基因组学蛋白质组学;20世纪人类科技发展史上的三大创举 ;人类基因组计划的启动 1986 年诺贝尔奖获得者R.Dulbecco（杜尔贝科）提出人类基因组计划—— 测出人类全套基因组的 DNA 碱基序列（ 3 X 109 bp ）;1975年，获诺贝尔生理医学奖 ; 美国政府决定于 1990年正式启动HGP，预计用 15 年时间，投入 30 亿美元，完成 HGP。 由国立卫生研究院和能源部共同组成“人类基因组研究所” 逐渐地，HGP 扩展为多国协作计划。参与者包括：英、日、法、德和中国（1993年）;DNA 测序技术飞速提高 J.C. Venter 等宣布，组建商业公司，投入 3 亿美元，3 年内完成。;第七页，共一百二十七页，2022年，8月28日;二000年六月二十六日克林顿宣布 人类基因组草图绘制完成;人类基因组草图基本信息;基因组学（genomics）：是阐明整个基因的结构、结构与功能的关系以及基因之间相互作用的科学。;第十一页，共一百二十七页，2022年，8月28日;第一节 基因组学;;基因组（genome）一词是由H Winkler于1920年提出来的，表示一个生物种配子中染色体的总和。现在基因组一词更常指细胞或生物体的全套遗传物质。;人类基因组计划的科学意义;第十六页，共一百二十七页，2022年，8月28日;一、人类基因组计划的主要研究内容;遗传图采用遗传学距离(genetic distance)作为图距，单位cM。 cM值越大，两者之间距离越远。人类基因组的遗传大小已经确定为3600cM。通过遗传图分析，可以了解各个基因或DNA片段之间的相对距离。;1、形态学标记;2、细胞遗传标记;家猪X、Y染色体G带示意图;细胞遗传标记的特点;3、生化与免疫遗传标记;同工酶与等位酶;等位酶分析的过程;生化与免疫遗传标记的特点;4、分子遗传标记;分子遗传标记的特点;5、理想的分子遗传标记应具备的特点;二、分子遗传标记;1、限制性片段长度多态性 ;RFLP的原理;限制性酶切长度多态性(RFLP);限制性内切酶的酶切原理：;DNA分子上多态性位点在等位基因中存在与否是不同的。;RFLP的特征;PCR－RFLP;PCR－RFLP的应用;检测不同个体RFLP的技术 ;Southern blot;PCR（Polymerase chain reaction） ;第四十二页，共一百二十七页，2022年，8月28日;第??十三页，共一百二十七页，2022年，8月28日;短串联重复序列(STR);小卫星序列（minisatellite），有时又称可变串连重复（variable number of tandem repeats, VNTR-），其重复单位的长度为数十个核苷酸。;DNA指纹图谱原理;VNTR示意图;第四十八页，共一百二十七页，2022年，8月28日;DFP的特点;⑵微卫星（microsatellite DNA, MS);微卫星遗传标记的原理;微卫星遗传标记示意图;SNP标记的特点;单核苷酸多态性（single nucleotide polymorphisms, SNPs） ;SNP标记的特点;;;检测SNP的特异杂交 ;DNA芯片（DNA chip）技术 ;DNA芯片 ;动态等位专一性杂交（Dynamic allele-specific hybridization, DASH） ;“遗传图”的建立为人类疾病相关基因的分离克隆奠定了基础。拥有5000多个遗传学位点，相当于把整个人类基因组划分为5000多个小区，并分别设置了“标牌”。这些标牌将在搜索功能基因的过程中发挥独特的作用。;把多态性的疾病基因位点（该位点至少包括“正常”及“致病” 两个等位基因）与上述遗传标记进行分析比较时，如果在家系中证实该基因与某个标记不连锁（重组率为50%），表明该基因不在这一标记附近。;如果发现该基因与某个标记有一定程度的“连锁”（重组率小于50%但大于0），表明它可能位于这个标记附近；如果该基因与某标记间不发生重组（重组率等于0），我们就推测该标记与所研究的疾病基因可能非常接近。;其它的DNA标记（分子标记）;遗传作图的方法;连锁分析;人类系谱分析的例子;酵母3号染色体遗传图与物理图比较;（二）物理图谱：人类基因组的物理图是指以已知核苷酸序列的DNA片段(序列标签位点，sequence-tagged site, STS)为“路标”，以碱基对(bp，kb，Mb)作为基本测量单位(图距)的基因组图。;物理作图常用的方法;用不同颜色标记的各种DNA序列（探针），与染色体上的互补序列杂交而不破坏染色体的整体形态，显微镜下观察、辨认荧光标记在染色体上的定位而绘制的图谱。;第七