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个人总结及展望主讲人:胡玲玲 第1页,共26页。 12345下一步工作主要工作介绍毕业提纲设想所学所感目录其他工作第2页,共26页。 1所学所感 习惯与养成QQ?新浪?微博?……1. 养成习惯,每天至少收一次邮件,最好用foxmail或outlook随时收邮件?2. 学会用中国知网、学术Google搜索论文?3.每周实验室都会有组会,文体活动,希望积极参加去?4.论坛注册并仔细读实验室工作板块的置顶帖子……第3页,共26页。 1所学所感研究生的开始一个简单的网站,根据用户输入的身份证前17位,计算第18位。第4页,共26页。 2主要工作介绍-简介数据挖掘流程 (1). 确定业务对象 (2). 数据准备    1)、数据的选择    2)、数据的预处理     3)、数据的转换 (3). 数据挖掘 (4). 结果分析 (5). 知识的同化 第5页,共26页。 2主要工作介绍-miRNA简介介绍microRNAMicroRNA(miRNA),是一种长度约为18-29个核苷酸(nucleotides)的非编码小分子RNA。作为小分子RNA 家族中的一员—MicroRNA已经受到广泛的关注, 在2006年度诺贝尔生理学或医学奖就颁发给了小分子RNA的研究者。第6页,共26页。 2主要工作介绍-miRNA简介介绍microRNA生物合成图第7页,共26页。 2主要工作一介绍-miRNA预测综述从头计算的miRNA计算识别方法逐渐流行,很多研究者提出自己的识别算法并发展相应的软件,但是各个软件和算法的识别效率,应用方法,功能范围等参差不齐,我们设计了一个新的测试数据集来衡量不同软件,方法的性能,为microRNA预测的研究提供参考。二级结构对RNA正常功能非常重要,有时甚至于较序列重要,这可以帮助用于分析非编码RNA,生物信息学的应用会使用一些二级结构的概念来分析RNA,所以我们分析了不同的二级结构预测软件。第8页,共26页。 2主要工作一介绍-miRNA预测综述第9页,共26页。 2主要工作二介绍-miRNA前体预测 microRNA序列预处理特征提取预测分类器投票结果第10页,共26页。 2主要工作二介绍-miRNA前体预测预测结果第11页,共26页。 2主要工作三介绍-miRNA家族分类研究显示miRNA有利于疾病和药物设计的发展,我们发现同样的家族总是拥有同样的发病机制和类似的工作机制,家族的研究一定程度上利于疾病和药物研究,我们提出了一种分层思想的家族预测方法,有效地预测miRNA的家族进而从PubMed中挖掘这个家族与一些疾病的关系。第12页,共26页。 主要工作三介绍-miRNA家族分类特征提取方法:n-gram2miRNA一共有四种碱基(A,C,G,U),对于N-Gram我们使用N=1,2,3…为了提取n-grams,用一个大小为n的滑动窗口在miRNA序列的5’到3’之间扫描,在序列上的每一个位置,被长度为n的滑动窗口覆盖的子序列都对应与一个n-gram,随着窗口移动,每一个遇到的n-gram的出现频率被记录下来。第13页,共26页。 主要工作三介绍-miRNA家族分类用n-gram特征提取2第14页,共26页。 主要工作三介绍-miRNA家族分类分层预测2第15页,共26页。 2主要工作三介绍-miRNA家族分类第16页,共26页。 2主要工作四介绍-miRNA物种差异miRNA 的降解或翻译抑制, 对多种生物学过程起调控作用,在植物和动物中,miRNA 执行这种调控作用的机理却不尽相同。同时miRNA 在动植物体内的形成过程也存在很多的不同之处。第17页,共26页。 动植物1)植物miRNA前体的茎环结构更大、更复杂,大约是动物中的3 倍长。2)加工方式不同3)植物miRNA具有较高的进化保守性,因此,对植物miRNA 目标基因的预测要相对简单。4)基因组上的存在位置不同。5)植物miRNA长度多为21 nt,而动物miRNA长度多为22~23 nt。6)作用机制不同2主要工作四介绍-miRNA物种差异第18页,共26页。 2主要工作四介绍-miRNA物种差异在生物进化过程中,动、植物从最后的共同祖先分化后,各自miRNA基因的进化是彼此独立的。但miRNA依然普遍存在于动、植物中,从一定侧面证明了miRNA对于生物个体形成和发展具有重要的意义。第19页,共26页。 3其他工作多示例学习图像检索学习第20页,共26页。 3其他工作多示例学习-多示例学习是与监督学习、非监督学习和强化学习并列的第四类学习框架,多示例学习被认为是基于事例的学习的最新进展,也是目前机器学习领域中最活跃的研究方向之一。第21页,共26页。 3其他工作图像检索学习第22页,共26页。 毕业论文实习4下一

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