生化蛋白质结构与功能.pptVIP

一、蛋白质的一级结构 定义： 指蛋白质中氨基酸的数目、排列顺序及共价连接 主要的化学键： 肽健，有些蛋白质还包括二硫键 (P8) 氨基酸序列书写： 以N-末端开始，C-末端结束，依次编1、2、3……… Cys Met Phe Lys Ser Thr Val NH2 COOH 当前第31页\共有87页\编于星期四\19点 胰岛素的一级结构 各种蛋白质的根本差异在于一级结构的不同 当前第32页\共有87页\编于星期四\19点 二、蛋白质的二级结构 定义： 是指蛋白质分子中一段多肽链的局部空间结构，即该段肽链主链骨架原子的相对空间位置，并不涉及到aa侧链R基团的构象 主要的化学键：氢键 负电性很强的原子（如氧或氮）和与氧或氮共价结合的氢原子相互吸引的作用力 当前第33页\共有87页\编于星期四\19点 蛋白质的二级结构类型： α－螺旋结构 (α－helix) β－折叠结构 (β－pleated sheet) β-转角 (β－turn) 无规卷曲 (random coil) 当前第34页\共有87页\编于星期四\19点 (一)α－螺旋 由肽键平面(肽单元)盘旋形成的右手螺旋状构象 1. 概念 当前第35页\共有87页\编于星期四\19点 2.α-螺旋的结构特征 (1)以肽键平面(肽单元)为单位,以α-碳原子为转折盘旋形成右手螺旋 当前第36页\共有87页\编于星期四\19点 (2) 每3.6个氨基酸残基 绕成一个螺圈(3600) 螺距为0.54nm 每个氨基酸上升0.15nm 肽键平面与中心轴平行 当前第37页\共有87页\编于星期四\19点 (3)主链原子构成螺旋的主体,侧链在其外部 当前第38页\共有87页\编于星期四\19点 (4)肽键的CO和NH 都形成氢键 是稳定螺旋的主要作用力 氢键的方向与中心轴大致平行, 当前第39页\共有87页\编于星期四\19点 （二）β－折叠 又叫?-片层，由两条或多条几乎完全伸展的肽链平行排列，通过链间的氢键交联而形成的。肽链的主链呈锯齿状折叠构象 在?-折叠中，?-碳原子总是处于折叠的角上，氨基酸的R基团处于折叠的棱角上 1.概念 当前第40页\共有87页\编于星期四\19点 2. β－折叠结构特点 (１) 相邻肽键平面的夹角为1100 ，呈锯齿状排列； 侧链Ｒ基团交错地分布在片层平面的两侧 当前第41页\共有87页\编于星期四\19点 当前第42页\共有87页\编于星期四\19点 (３)由氢键维持稳定。其方向与折叠的长轴接 近垂直 (２) ２～５条肽段平行排列构成，肽段之间可 顺向平行(均从N-C)，也可反向平行 当前第43页\共有87页\编于星期四\19点 (三)β－转角 肽链出现1800回折的转角处结构称为β－转角 1.概念 2.结构特征 *第一个残基的C=O与第四个 残基的N-H形成氢键 *常见于球状蛋白质分子表面 当前第44页\共有87页\编于星期四\19点 (四)无规卷曲 概念 没有确定规律性的肽键构象 常见于球状蛋白质分子中，在其它类型二级结构肽段之间起活节作用，有利于整条肽链盘曲折叠 当前第45页\共有87页\编于星期四\19点 当前第46页\共有87页\编于星期四\19点 (五)超二级结构 指在多肽链内顺序上相互邻近的二级结构常常在空间折叠中靠近，彼此相互作用，形成规则的二级结构聚集体 具有特殊功能的超二级结构，被称为模体（motif） 当前第47页\共有87页\编于星期四\19点 钙结合蛋白中结合钙离子的模体 锌指结构 当前第48页\共有87页\编于星期四\19点 三、蛋白质的三级结构 （一）定义 一条肽链中全部氨基酸残基的相对空间位置，也就是整条肽链所有原子在三维空间的排布位置 主要的化学键： 疏水键、盐键(离子键)、氢键、范德华力 当前第49页\共有87页\编于星期四\19点 卵溶菌酶的三级结构含有?螺旋、?-折叠、?-转角和无规卷曲四种二级结构 当前第50页\共有87页\编于星期四\19点 疏水键示意图 疏水键 由非极性基团受到水分子排斥相互聚集在一起的作用力 当前第51页\共有87页\编于星期四\19点 离子键 由异性电荷间的静电吸引形成 当前第52页\共有87页\编于星期四\19点 氢键 负电性很强的原子（如氧或氮）和与氧或氮共价结合的氢原子相互吸引，这种作用力称为氢键 当前第53页\共有87页\编于星期四\19点 当前第54页\共有87页\编于星期四\19点 （二）结构域 在较大的蛋白质分子中，由于多肽链上相邻的超二级结构紧密联系，形成两个或多