蛋白预测转录后修饰及其相互作用.pptVIP

以列表形式给出结果 当前第31页\共有62页\编于星期三\15点 结果说明 glycosylated sites + Potential 0.5 ++ Potential 0.5 AND Jury agreement (9/9) OR Potential0.75 +++ Potential 0.75 AND Jury agreement ++++ Potential 0.90 AND Jury agreement and non-glycosylated sites: - Potential 0.5 -- Potential 0.5 AND Jury agreement (all nine 0.5) --- Potential 0.32 AND Jury agreement WARNING: PRO-X1. Proline occurs just after the Asparagine residue. This makes it highly unlikely that the Asparagine is glycosylated, presumably due to conformational constraints. WARNING: PRO-X2. Proline occurs at the 3rd position C-terminal to the Asparagine in question (2nd X in NX[ST]X). This makes it somewhat unlikely that the Asparagine is glycosylated, but this condition is not as harsh as the PRO-X1 condition. 当前第32页\共有62页\编于星期三\15点 当前第33页\共有62页\编于星期三\15点 练习 预测一下CD133蛋白上可能的N糖基化位点 当前第34页\共有62页\编于星期三\15点 O-糖基化 蛋白质O-糖基化位点有及其重要的意义，神经系统中O-糖链结构抗原在神经发育的神经元轴表面分布广泛，另外，O-糖基化也是细胞恶变和肿瘤发育的重要标志。 主要类型： O-GlcNac，O-mannose,O-fucose,等 当前第35页\共有62页\编于星期三\15点 O-糖基化预测 当前第36页\共有62页\编于星期三\15点 P00533 生长因子受体 当前第37页\共有62页\编于星期三\15点 粘蛋白（mucin）是上皮粘液的主要成分，具有高分子量和高糖基化，糖链占其分子量的50%-90%，富含O糖基化 当前第38页\共有62页\编于星期三\15点 当前第39页\共有62页\编于星期三\15点 当前第40页\共有62页\编于星期三\15点 当前第41页\共有62页\编于星期三\15点 当前第42页\共有62页\编于星期三\15点 练习 分析一下CD43和CD82可能的O-糖基化位点 当前第43页\共有62页\编于星期三\15点 CD43 当前第44页\共有62页\编于星期三\15点 * 蛋白质合成后的分泌及加工修饰 不论是原核还是真核生物，在细胞浆内合成的蛋白质需定位于细胞特定的区域，有些蛋白质合成后要分泌到细胞外，这些蛋白质叫做分泌蛋白。在细菌细胞内起作用的蛋白质一般靠扩散作用而分布到它们的目的地。如内膜含有参与能量代谢和营养物质转运的蛋白质；外膜含有促进离子和营养物质进入细胞的蛋白质；在内膜与外膜之间的间隙称为周质，其中含有各种水解酶以及营养物质结合蛋白。 真核生物细胞结构更为复杂，而且有多种不同的细胞器，它们又具有各不相同的膜结构，因此合成好的蛋白质还要面临跨越不同的膜而到达细胞器械，有些蛋白质在翻译完成后还要经过多种共价修饰，这个过程叫做翻译后处理。 当前第1页\共有62页\编于星期三\15点 运输标签---信号肽 信号肽是未成熟蛋白质中，可被细胞转运系统识别的特征氨基酸序列。蛋白质在核蛋白体合成后要靶向输送到其执行功能的目标地点。穿过合成所在细胞到其他组织细胞中的蛋白质统称为分泌性蛋白质。分泌性蛋白上有一段疏水性氨基酸较多的肽段，称为信号肽（signal peptide），其作用是把合成的蛋白质移向细胞膜并与胞膜结合，然后把合成蛋白送出胞外。 当前第2页\共有62页\编于星期三\15点 当前第3页\共有62页\编于星期三\15点 信号肽一级结构特征 一般由10多个至40多个氨基酸残基组成，大致分为三个区段。 N端有带正电荷的氨基酸，如赖氨酸和精氨酸，称为碱性氨基末端。中间较大的或更多的以中性氨基酸为主组成疏水核心区，常见有亮