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N6-甲基腺嘌呤甲基化在人类恶性肿瘤中的研究进展
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赵学辉,孙亚男
(哈尔滨医科大学附属第二医院耳鼻咽喉头颈外科,哈尔滨 150086)
据全球癌症统计,2020年约有1 930万新发癌症病例和近1 000万癌症死亡病例,预计2040年,全球新发癌症病例将达2 840万,较2020年增加47%[1]。在全世界范围内,癌症均是导致死亡的主要原因之一,也是提高预期寿命的重要障碍。因此,迫切需要更好地掌握恶性肿瘤的分子发病机制以开发出早期检测肿瘤的标志物和新的关键基因靶标。表观遗传学与肿瘤的发生发展密切相关[2],转录后修饰作为多种生理过程和疾病进展的重要调控因子,越来越受到生命科学研究的重视,其中甲基化是当前研究的热点,且RNA甲基化修饰已成为表观遗传学研究的新方向。RNA的甲基化修饰广泛存在于各种类型的RNA中,截至2017年,在生物体内已经发现了170余种RNA转录后修饰[3]。这些修饰包括N7-甲基鸟嘌呤、N6-甲基腺嘌呤(N6-methyladenosine,m6A)、N5-甲基胞嘧啶、N1-甲基腺嘌呤和2′-O-甲基化修饰。其中,m6A的修饰约占信使RNA(messenger RNA,mRNA)修饰的80%,是最为丰富的mRNA修饰。现就m6A甲基化在人类恶性肿瘤中的研究进展予以综述。
1 m6A的概述
1.1m6A的发现及分布 作为mRNA上最丰富的甲基化修饰,m6A是发生在碱基第6位N原子上的甲基化,是通过m6A甲基转移酶使S-腺苷甲硫氨酸的甲基转移到腺嘌呤上,是真核生物中最常见的转录后修饰,大量存在于mRNA和长链非编码RNA中,广泛发现于真核生物(如酵母、植物、苍蝇、哺乳动物[4])和原核生物[5](如细菌、支原体和病毒)中。20世纪70年代,Desrosiers等[6]在肝癌细胞中第一次发现m6A修饰,因其并没有改变原有碱基序列,同时缺乏有效检测手段,故未对m6A的功能和性质进行深入研究。2012年,Meyer等[7]应用m6A RNA甲基化免疫沉淀测序方法发现了m6A的具体分布情况,即主要分布在mRNA的3′非翻译区、终止密码子的编码序列和长链内部外显子区[8]。随着甲基转移酶、去甲基化酶和甲基结合蛋白酶类陆续发现,研究者逐渐认识到m6A是动态的可逆性修饰,且高度保守[9],这些酶被何川教授形象地称为“书写”“擦除”和“读取”蛋白[10],所以m6A修饰方式也可分为甲基化、去甲基化和结合形成甲基位点3种[11]。
1.2m6A甲基转移酶 甲基转移酶类是一种多成分复合物。1994年,Bokar等[12]发现了甲基转移酶样蛋白(methyltransferase like protein,METTL)3和METTL14,并证明METTL3是m6A甲基转移酶复合物的主要活性成分,可与METTL14形成稳定复合物。此外,肾母细胞瘤1-相关蛋白(Wilms tumor 1-associating protein,WTAP)也是m6A甲基转移酶复合物重要成分。WTAP与METTL3-METTL14共同定位于核散斑处,形成m6A主要“书写”蛋白复合物核心,并通过甲基转移酶复合物进行转录安装。现已发现甲基转移酶复合物由METTL3催化亚基和辅助亚基组成,辅助亚基包括METTL14、WTAP、Vir样m6A甲基转移酶相关蛋白(Vir like m6A methyltransferase associated protein,VIRMA)、RNA结合基序蛋白15和CCCH型锌指蛋白13(zinc finger CCCH domain-containing protein 13,ZC3H13)等[13]。其中,METTL3与METTL14形成稳定复合物,并在底物识别中起关键作用[14];WTAP保证METTL3-METTL14异二聚体在核斑点上定位,并促进其催化活性[15];RNA结合基序蛋白15B与m6A甲基化复合物结合并将其招募到RNA特定位点上[16];ZC3H13将WTAP连接到RNA结合因子Nito上[17];KIAA1429也被称为VIRMA,在已知的“书写”蛋白中,KIAA1429缺失导致的m6A甲基化减少最明显[18];HAKAI也是甲基转移酶复合物重要组成部分[19]。截至目前,m6A甲基转移酶的核心成分为METTL3-METTL14-WTAP-VIRMA-HAKAI-ZC3H13[20]。
1.3m6A去甲基化酶 2007年,Gerken等[21]发现脂肪量和肥胖相关蛋白(fat mass and obesity-associated protein,FTO)可将单链DNA上3-甲基胸腺嘧啶去甲基化,表现出脱甲基作用。由于FTO可导致肥胖及脂肪堆积[22],因而猜测FTO可能是通过脱甲基作
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