高斯软件-基础教程.docxVIP

GaussView界面教程【1】——界面介绍 Gview是一个特意设计于高斯配套使用的软件，其主要用途有两个：建立高斯的输入文件；以图的 形式显示高斯计算的结果。除了能够自己建立输入文件外，Gview还可读入Chem3D，HyperChem和晶体数据等诸多格式的文件。进而使其能够于诸多图形软件连用，大大拓宽了使用范围。 开启GaussView会看到一大一小两个窗口，后边灰色背景的窗口为选择窗口，在里面选摘要输入的分子或基团；前面紫色的窗口为画图窗口，使用鼠标绘制想要绘制的图形。 精心整理 菜单栏 File】主要功能是成立，翻开，保留和打印目前的文件 Edit】达成对分子的剪贴、拷贝、删除、抓图等 View】与显示分子有关的都在这个菜单下，如显示氢原子、键、元素符号、坐 标等 Calculate】直接向Gaussian提交计算 Results】接收并显示Gaussian计算后的结果 Windows】控制窗体，如封闭、恢复等 Help】帮助 快速工具栏 【左面第一个】选择元素与价键，单击翻开会看到一个元素周期表，经过它能够选择需要绘制的元素以及价态。 精心整理 【左面第二个】环工具，作用与上一个差不多，不过这里供给的都是环状化合物残基； 精心整理 【左面第三个】供给常用的R基团模板，此中包含乙基、丙基、异丙基、异丁基等 精心整理 【左面第四个】氨基酸残基，使用它能够快速绘制氨基酸 【左面第五个】用户自定义基团，您能够将常用的基团寄存到此处 这条快速编写栏中从左到右挨次是【键调整】|【键角调整】|【二面角调整】|【查问已有构造】|【增添化学键】|【删除化学键】|【翻转原子】|【单个选择】|【框选】|【去除选择】|【全选】 这里面的全部选项都能够经过在画图窗口点击右键获得。 精心整理 3、常用工具栏 这两条条工具栏是最常用的，几乎全部软件都有的新建翻开等工具 GaussView教程【2】——建立分子 这里以建立一个间氟苯乙烷分子并从GaussView里递交计算为例来说明。 1、开启Gview 2、双击按钮，选择苯基（第一个），会看到主程序框体中出现苯环 精心整理 在工作窗口单击，能够看到工作窗口也出现了一个苯环。 单击左键，能够将主程序框体中的分子或基团加入到工作窗口； 按上下左右键，或许左键单击不放挪动鼠标，能够调理分子的角度； 转动鼠标滚轮，能够放大减小分子； 按住shift键，左键单击不放挪动鼠标，能够挪动分子； 当工作窗口内有多个分子时（在建立大的分子时，这类状况很简单出现） 用Shift+Alt+鼠标左键组合，挪动想要挪动的分子； 精心整理 用Ctrl+Alt+鼠标左键组合调理此中一个分子的角度； 双击图标（或许左键不放），在元素周期表中选择【F】元素，回到工作窗口在苯的随意一个【H】上单击，使之变为【F】 双击图标，从链烃库中选择【乙基】（第一个），而后点击间位上的【H】即可 精心整理 至此，分子式已经建立达成，Gview储存个人常用分子的功能，双击view上的图标，在下边 的对话框中键入有关项目，保留即可。 （注：我的程序此项功能不可以，用户自定义基团） 精心整理 查察分子坐标：单击Gview界面的图标，查察分子的坐标。 精心整理 至此，我们保留一下我们建立好的间氟苯乙烷分子，在画图界面右键单击【File】——【Save】 而后选择保留路径即可。 精心整理 GaussView教程【3】——向Gaussian提交计算 上一讲我们已经建立好了一个间氟苯乙烷分子，此刻翻开间氟苯乙烷分子。 点击Gview界面上的【Calculate】——【GaussianCalculateSetup】 精心整理 从对话框中我们能够选择很多参数，下边挨次选择一下 精心整理 JobType】工作种类： Energy能量】|【Optimization优化】|【Frequency频次】|【Opt+Freq优化＋频次】 |【Scan扫描】|【Stability稳固性】|【NMR核磁】， 这里我们选择【NMR】核磁 【Method】方法：每种计算模式都供给了若干种方法，这里选择默认值即可 Title】题目：这项能够依据自己的项目自行命名 Link0】给检查点文件命名 其余选择默认即可 选好后点击【Submit】提交至Gaussian，并保留。（最好存到安装文件所在磁盘） 精心整理 系统会咨询能否提交至Gaussian，选择【OK】，Gaussian会自动开启并计算，计算时间因硬件配置而异 精心整理 计算完成后系统会提示封闭Gaussian，点击【是】 计算完成后会生成两个文件，.log的是系统日记，便于查察计算结果。这里我们选择.chk文件【Ok】 接下来我们又一次看到了方才绘制的那个分子，表面上没什么不一样，但此次我们能够预知它的许 多性质了，在GVi