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Ubp3对酵母细胞中游离K63泛素链的降解作用研究的中期报告
序言
K63链化的泛素是一类在细胞信号转导中起重要作用的泛素连接物,其通过与信号转导组件结合促进特定信号通路的激活或下调,从而参与调节基因表达、细胞增殖、免疫应答等生物学过程。K63泛素链的动态修饰在细胞过程中受到复杂调控,其中泛素酶的作用是其中一种重要的调控机制。Ubp3是酿酒酵母中的K63链特异性泛素酶,其在游离K63链的降解中起到重要作用。因此,本文将围绕Ubp3对酵母细胞中游离K63泛素链的降解作用进行研究,进一步揭示Ubp3在调节K63泛素链修饰水平上的功能。
材料与方法
实验材料:
酵母菌株:野生型酿酒酵母(S. cerevisiae)
实验仪器:低温离心机,超速离心机,杂交仪,PCR仪,蛋白质电泳仪等。
实验方法:
1.构建Ubp3基因敲除菌株
采用PCR法扩增Ubp3敲除基因片段并构建敲除菌株。
2.检测菌株中K63泛素链的含量
采用Western blotting方法检测 Ubp3敲除菌株和野生型菌株中游离K63泛素链的含量。
3.观察Ubp3对菌株中K63链水平变化的影响
采用菌落形态观察法检测Ubp3敲除菌株和野生型菌株在高碘酸钾(KIO3)条件下的生长情况,进一步观察Ubp3对K63链水平变化的影响。
预期结果
通过敲除Ubp3基因,预期会导致K63泛素链的积累,从而影响细胞各种生理参数。Western blotting检测结果将验证敲除Ubp3基因是否导致K63泛素链的含量增多。进一步,通过菌落形态的观察,预期会发现敲除Ubp3基因的菌落在高碘酸钾环境下生长缓慢,生长规律发生变化,进一步证实了Ubp3在调节K63泛素链修饰水平上的重要性。
结论
本文将通过研究Ubp3对酵母细胞中游离K63泛素链的降解作用,揭示K63泛素链修饰水平调控机制中泛素酶的作用。通过敲除Ubp3基因的实验,将进一步验证Ubp3在K63泛素链的降解机制中的重要作用,并为深入探究Ubp3在细胞SOS信号通路调控中的作用提供基础。
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