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增强子作用机理: 本文档共105页;当前第63页;编辑于星期六\11点51分 第三节 反式作用因子(转录因子)对转录的影响 一、转录因子的类型; 二、转录因子的DNA结合结构域; 三、转录因子的蛋白质结合结构域 本文档共105页;当前第64页;编辑于星期六\11点51分 一、转录因子的类型 1、具有普遍性作用的通用转录因子 一般作用于类型Ⅱ基因的基本元件,如TATA框和转录起始区域(INR),一般参与启动子上转录起始反应。它们使启动子进行低水平基础性转录,可以被转录活化因子进一步激活,也可被转录抑制因子阻遏。 是参与转录起始或终止的非特异性转录因子 本文档共105页;当前第65页;编辑于星期六\11点51分 一、转录因子的类型 2、细胞或基因特异性转录调控因子 作用于转录起始复合物形成过程中的某些靶分子和控制位点,往往含有DNA序列特异性结合的结构域和激活(活化)结构域。 DNA序列特异性结合的结构域使它们结合、固定到启动子上游调控区上。活化结构域被认为是直接或间接地接触到普遍性转录因子内的靶位点上,对转录的起始过程实行调控。 本文档共105页;当前第66页;编辑于星期六\11点51分 TF Ⅱ D 的一个亚基TBP即TATA框结合蛋白,是一个普遍性的转录因子 本文档共105页;当前第67页;编辑于星期六\11点51分 TF Ⅱ D的一个亚基是特异识别TATA框的,称为TATA框结合蛋白(TBP);其余亚基叫TBP-相关因子(TAF); 起始复合物的组装过程: TF Ⅱ D(TBP、TAFs)+DNA+ TF Ⅱ A+ TF Ⅱ B+ (TF Ⅱ F+ RNA pol Ⅱ )+ TF Ⅱ E 由RNA pol Ⅱ与通用转录因子组成基础转录装置——起始复合物 本文档共105页;当前第68页;编辑于星期六\11点51分 RNA pol Ⅱ的上游元件及其转录因子 上游元件:TATA框、GC框、CAAT框、八聚体(Octamer,一个8bp元件)。 转录因子: 1、TATA框结合蛋白:TFⅡD、TFⅡA、TFⅡB、TFⅡE等; 2、SP1:结合到GC框,能与启动子的任一条链结合。其DNA结合域在C端,含有三个锌指。 3、结合CAAT框的因子:有多种,其中一类是CTF家族,其成员与CAAT框的亲和力相同;另一类是CP家族,其成员与不同启动子的CAAT框的亲和力不同。 本文档共105页;当前第69页;编辑于星期六\11点51分 二、转录因子的DNA结合结构域 1、锌指(Zinc finger region) 2、亮氨酸“拉链”式二聚体(leucine zipper); 3、螺旋-环-螺旋结构(helix-loop-helix,HLH); 4、结合相关靶DNA的同源域(hemeo domain): 本文档共105页;当前第70页;编辑于星期六\11点51分 Three major categories of transcription factor protein 本文档共105页;当前第71页;编辑于星期六\11点51分 1、锌指: 定义:保守氨基酸的残基与锌离子结合,使中间的氨基酸残基回折成一种手指状结构,称为锌指。 结构:保守序列:Cys-X2-4-Cys-X3-Phe-X5-Leu-X2-His-X3-His; Cys2/His2锌指,Cys2/Cys2锌指; 功能:锌指区负责识别并结合于DNA上特异的目标位点。 有两类与DNA结合的蛋白质具有这种结构,即经典的锌指蛋白与类固醇受体。不同蛋白质锌指数目不同。 本文档共105页;当前第72页;编辑于星期六\11点51分 大部分的锌指区都聚合成一组,但也有的不止一个锌指簇,一般认为,如果某个蛋白具有一个或多个成簇的锌指区,那么它很可能就是转录因子。 本文档共105页;当前第73页;编辑于星期六\11点51分 锌指区结构都是以锌将一个α 螺旋与一个反向平行的β折叠片的基底通过半胱氨酸和组氨酸之间形成配位键连接起来,指环上的赖氨酸和精氨酸参与DNA的结合 结合在DNA大沟中重复出现,所以结合牢固。 本文档共105页;当前第74页;编辑于星期六\11点51分 本文档共105页;当前第31页;编辑于星期六\11点51分 实例二:人类血红蛋白; 人类血红蛋白基因 基因家族成员的发育阶段特异性表达是通过基因重排的方式决定的, 这种变化是不可逆的。 本文档共105页;当前第32页;编辑于星期六\11点51分 四、DNA甲基化与基因活性的调控 DNA甲基化能关闭某些基因的活性,去甲基化则诱导了基因的重新活化与表达。其机理是DNA甲基化导致某些区域DNA构象变化,从而影响了蛋白质与DNA的相互作
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