基于纯培养方法和PacBio三代测序技术研究蒙古国传统酸马奶中乳酸菌多样性.pdfVIP

第卷第期中国食品学报

194Vol．19No．4

年月Apr．

20194JournalofChineseInstituteofFoodScienceandTechnology2019

基于纯培养方法和PacBio三代测序技术研究蒙古国

传统酸马奶中乳酸菌多样性

刘文俊多拉娜刘亚华任冬艳张和平孟和毕力格*

（内蒙古农业大学乳品生物技术与工程教育部重点实验室农业农村部奶制品加工重点实验室

内蒙古自治区乳品生物技术与工程重点实验室呼和浩特010018）

摘要通过纯培养方法结合三代测序技术对采自蒙古国的份传统酸马奶中的乳酸菌多样性进行研

PacBio12

究。应用传统的纯培养技术从份传统酸马奶样品中分离出株乳酸菌，通过基因序列分析和系

126216SrRNA

统进化关系研究，株乳酸菌被鉴定为个属，个种，分别是：株瑞士乳杆菌、株植物乳杆菌、株产马乳

625625207

酒乳杆菌、株屎肠球菌、株嗜热链球菌和株粪肠球菌。采用测序技术研究其中份样品中乳

532PacBioSMRT8

酸菌的多样性，宏基因组测序得到的优势菌为乳酸菌，同时也检测到一些痕量的其它种属细菌。共检测到5个

乳酸菌的属，分别是：乳杆菌属、乳球菌属、链球菌属、明串珠菌属和肠球菌属，个乳酸菌的种，即：瑞士乳杆

20

菌、乳酸乳球菌、副乳链球菌、棉子糖乳球菌、肠膜阴串珠球菌和产马乳酒乳杆菌。宏基因组测序相对含量表明：

蒙古国酸马奶样品中乳酸菌优势属为乳杆菌属（95.56%），优势种为瑞士乳杆菌（94.64%），纯培养方法和宏基因

组三代测序方法都表明瑞士乳杆菌为蒙古国传统酸马奶中的优势菌种。宏基因组测序技术除检测到纯培养获

得的菌株外，还获得14个低丰度乳酸菌，如棉籽糖乳球菌、肠膜明串珠球菌和开菲尔乳杆菌等，这些菌在酸马

奶中含量较少。通过PacBioSMRT测序技术可以全面了解酸马奶中乳酸菌的多样性，为通过纯培养方法获得低

丰度乳酸菌提供指导。

关键词酸马奶；乳酸菌；PacBioSMRT测序技术；生物多样性

文章编号（）：

1009-7848201904-0027-11doi10.16429/j.1009-7848.2019.04.003

酸马奶是以新鲜马奶为原料，经乳酸菌和酵有一定疗效[5]。酸马奶中的乳酸菌赋予酸马奶独特

母菌等微生物共同自然发酵形成的酸性、低酒精风味特征，同时其代谢产物与酸马奶的医疗作用

含量的乳饮料[1]。酸马奶中含有丰富的蛋白质、脂密不可分。全面深入了解传统酸马奶中的细菌多

肪、糖类、维生素、氨基酸等营养成