药物及生物活性小分子发现与分子设计.pptVIP

关于药物及生物活性小分子发现与分子设计第1页，讲稿共22页，2023年5月2日，星期三SwissTargetPrediction映射活性小分子的目标分子可以预测潜在机理和副作用——用于生物活性小分子靶点预测生物活性小分子连接到蛋白或者大尺寸目标分子来调节生物活性：第2页，讲稿共22页，2023年5月2日，星期三SwissTargetPrediction——用于生物活性小分子靶点预测特点：结合2D和3D相似性测量；预测可针对五个不同生命体；数据集包括280381个小分子与2686个目标相互作用，其中66％的目标是人类的；第3页，讲稿共22页，2023年5月2日，星期三3D相似性计算：18维特征实数向量：每个分子通过ChemAxonmolconvert工具生成20个同分异构体；超过20个时，选择能量最低的构象；不足20个时，则选择全部构象；Manhattan距离：构象x和y特征的曼哈顿距离计算公式：最终的3D相似值计算公式：dij是20×20组里最小曼哈顿距离，所以s’1是其中最大值。SwissTargetPrediction——用于生物活性小分子靶点预测第4页，讲稿共22页，2023年5月2日，星期三2D相似性计算：指纹描述分子：分子指纹是一个多“位(bit)”的编码，每一位代表着某种预定义的子结构；如果该子