蛋白质组与蛋白质组学.pptVIP

********************************************************************蛋白芯片(proteinchip)技术?基本方法?蛋白质的结合：未经处理的样品(如血清，尿液等)直接点在芯片上，根据芯片表面不同的化学或生物特性结合相应的蛋白质；?清洗减少非特异性蛋白(如盐及其它污染物)的结合；?加能量吸收分子(EAM)：EAM能有效的吸收激光的能量，使样品分子进入气相并得到电离；?用表面增强的激光解吸电离法(SELDI)将保留在芯片上的蛋白质洗脱下来；?电离的蛋白质可以通过飞行时间质谱仪精确地测定它们的质量；第31页,共49页，星期六，2024年，5月蛋白芯片(proteinchip)技术从未经提纯的生物或临床样品中直接捕获、检测和分析蛋白质不需任何标记或加尾超高的检测灵敏度(1-50fmole的蛋白质)从超小样品体积(0.5μl)到大体积(400μl)快速获取实验结果第32页,共49页，星期六，2024年，5月蛋白芯片(proteinchip)技术?ProteinChip的应用第33页,共49页，星期六，2024年，5月蛋白质芯片第34页,共49页，星期六，2024年，5月原理样品分子离子化后，根据不同离子间的质量和电荷比值（质荷比，m/e）的差异确定分子量。应用蛋白质的序列分析研究蛋白质的修饰（五）质谱技术二、分析鉴定第35页,共49页，星期六，2024年，5月（六）其它方法Edman降解法测定蛋白质多肽的排列顺序。核磁共振（NMR）、荧光光谱法测定溶液中蛋白质分子的结构。X射线衍射分析法、小角中子衍射法测定晶体蛋白质的分子结构等。二、分析鉴定第36页,共49页，星期六，2024年，5月蛋白质数据库及其应用

第37页,共49页，星期六，2024年，5月蛋白质数据库及其应用二、蛋白质数据库的应用

一、蛋白质数据库(ProteinDatabase)第38页,共49页，星期六，2024年，5月一、蛋白质数据库（一）蛋白质序列数据库（二）蛋白质结构数据库（三）蛋白质直系同源簇数据库（四）DIP数据库第39页,共49页，星期六，2024年，5月一、蛋白质数据库（一）蛋白质序列数据库SWISS-PROT数据库：http://www.ebi.ac.uk/swissprotPIR和PSD数据库//pir第40页,共49页，星期六，2024年，5月蛋白质数据仓库/pdb/蛋白质结构分类数据库http://scop.mrc-lmb.cam.ac.uk/scop/PROSITE数据库http://www.expasy.ch/proside/（二）蛋白质结构数据库一、蛋白质数据库第41页,共49页，星期六，2024年，5月（三）蛋白质直系同源簇（COGs)数据库/COG（四）DIP数据库(DIPDatabase)/一、蛋白质数据库第42页,共49页，星期六，2024年，5月二、蛋白质数据库的应用（一）序列比较序列两两对比多序列对比（二）临床诊断（三）肿瘤治疗药物的开发第43页,共49页，星期六，2024年，5月第44页,共49页，星期六，2024年，5月第45页,共49页，星期六，2024年，5月第46页,共49页，星期六，2024年，5月第47页,共49页，星期六，2024年，5月第48页,共49页，星期六，2024年，5月感谢大家观看第49页,共49页，星期六，2024年，5月**************************关于蛋白质组与蛋白质组学蛋白质组学DNAmRNA蛋白质转录翻译基因蛋白质细胞特异性基因表达生理状态蛋白质相互作用温度应激状态培养条件药物作用数量有限结构相对稳定复杂性多变性直接反应生命现象复杂的调控第2页,共49页，星期六，2024年，5月蛋白质组与蛋白质组学的定义蛋白质组protein+genom