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ခ６５４ခ药学研究ခＪｏｕｏｒＰｈｆｎａｌａｒｍａｃｅｕＲｅｓｅａ２０２３ｔｉｃａｌｒＶｃｏｌ.４２ｈꎬＮｏ.９
基于生物信息学和ＣＭａｐ数据库分析肺癌相关基因及潜在治疗药物
张虎ꎬ黄欣ꎬ李妍ꎬ韩毅ꎬ李羚
(山东第一医科大学第一附属医院山东省千佛山医院临床药学ꎬ山东省儿童药物临床评价与研发工程技术研究中心ꎬ
山东省医药卫生临床药学重点实验室ꎬ山东济南２５００１４)
摘要:目的基于生物信息学和关联性图谱(ＣＭａｐ)数据库筛选肺癌相关基因及其潜在的治疗药物ꎬ为肺癌的
治疗提供新思路ꎮ方法从基因表达数据库(ＧＥ)Ｏ中选择ＧＳＥ８９０３９、ＧＳＥ１１８３７０和ＧＳＥ１３６０４３ꎬ采用Ｒ软件筛选
－
差异表达基因(ＤＥＧｓ)ꎬ将ＤＥＧｓ进行ＧＯ和ＫＥＧＧ富集分析ꎬ并构建蛋白质蛋白质相互作用(ＰＰＩ)网络ꎻ使用基因
表达谱交互分析(ＧＥＰＩＡ)验证枢纽基因的表达以及预后价值ꎻ采用ＣＭａｐ数据库筛选具有肺癌治疗作用的潜在候
选药物ꎮ结果我们共确定了５３０个ＤＥＧｓꎬ包括１５０个上调基因和３８０个下调基因ꎮ这些ＤＥＧｓ主要富集在细胞
－
外基质(ＥＣＭ)受体相互作用、细胞黏附等方面ꎮＰＰＩ网络由５２７个节点ꎬ１２９８条连接线组成ꎬ前十个枢纽基因分
别为ＳＤＣ１、ＣＤＨ５、ＦＧＦ、Ｐ２ＥＣＡ、Ｍ１ＩＬ、Ｃ６ＡＶ、ＭＭ１Ｐ、９ＳＰＰ、ＶＷＦ１、ＰＰＡꎮＲＧ通过ＧＥＰＩＡ分析这些枢纽基因相关的
总生存期(ＯＳ)ꎬ结果显示ＳＰＰ对１ＯＳ具有显著影响ꎮ使用ＣＭａｐ数据库筛选出的对肺癌具有潜在治疗作用的ＦＤＡ
批准上市的候选药物ꎬ包括腺苷脱氨酶抑制剂(克拉屈滨)、核糖苷还原酶抑制剂(氯法拉滨)、抗病毒药(阿糖腺
苷)、拓扑异构酶抑制剂(替尼泊苷)、ＲＮＡ聚合酶抑制剂(放线菌素)、抗代谢药物(阿糖胞苷)ꎮ结论借助生物
信息学和ＣＭａｐ数据库挖掘发现克拉屈滨等药物对肺癌具有潜在的治疗作用ꎮ本研究为寻找肺癌的治疗方案提供
了新的思路ꎬ具有重要的临床意义ꎮ
关键词:肺癌ꎻ差异表达基因ꎻ生物信息学ꎻＣＭａｐ数据库
－－－
中图分类号:Ｒ７３４.２文献标志码:Ａ文章编号２０２３)０９０６５４００７
ｄｏｉ:１０.１３５０６/ｊ.ｃｎｋｉ.ｊｐｒ.２０２３.０９.００３
Ｉｄｅｎｔｉｆｏｉｃａｆｈｕｂｇｅｎｅｔｉｏｎａｎｓｐｏｄｔｅｎｃａｎｔｉａｌｄｉｄｒｄａｕｇｔｆｅｏｓｌｕｎｇｒｃａｎｃｅｒ
ｖｉａｂｉｏｉｎｆｏａｎｒｍａＣＭａｐｄｔｉｃｓ
ＺＨＡＮＨｕＧꎬＨＵＡＮＸＧｉｎꎬＬＩＹａｎꎬＨＡＮＹꎬｉＬＩＬｉｎｇ
(ＳｈａｎｄＥｎｇｉｎｅｅｏｎｇａｎＴｅｃｒｄｉｎｇｈｎｏｌｏｇＲｅｓｅａＣｅｎｙｒｃｆｔｈｏｅＰｒｒｅｄｉａＤｒｔｒｕｇＤｉｃｅｖｅｌｏｐｍｅｎꎬＳｈａｎｄｔｏｎｇ
ＭｅｄｉｃｉｎｅａｎＨｅａｌｄＫｅｔｈＬｙａｂｏｒｏａＣｌｉｎｉｃａｌｆｔｏｒｙＰｈａｒꎬｍａｃＤｅｐａｙｒｔｏｍｅｎＣｌｉｎｉｃａｌｆｔＰｈａｒꎬｍａｃｙ
ＴｈＦｅｉＡｆｆｒｓｔｉｌｉａＨｏｓｐｉｔｏｅＳｈｆｄｔａｌａｎｄＦｏｎｇｉＭｅｒｓｔｄｉｃａｌＵｎｉｖｅ＆ｒｓＳｈｉａｎｔｙｄｏｎｇ
ＰｒｏｖｉｎｃｉａｌＱｉａｎｆＨｏｏｓｈｓꎬｐｉａｎＪｉｎａｎｔａｌ２５００１４ꎬＣｈｉｎａ)
Ａｂｓｔｒ:ＯｂａｃｊｅｃｔｔＴｏｉｖｓｃｅｒｅｅｎｈｕｂｇｅｎｅａｎｓｐｏｄｔｅｎｃａｎｔｉａｌｄｉｄｒｄａｕｇｆｔｏｅｓｌｕｎｇｒｃａｎｃｅｖｉａｂｒｉｏｉｎｆｏａｎｒｍ
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