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蛋白质的分子式

一、蛋白质分子的结构层次

二、稳定各级结构的作用力

一级结构：肽键、二硫键共价键

二级结构：氢键（主要作用力）

超二级结构疏水相互作用

结构域范德华力（引力与斥力）

三级结构离子键

四级结构配位键

三、蛋白质的一级结构

1.定义:蛋白质的一级结构是指多肽链中氨基酸的序列，包括二硫键位置。

2.主要化学键:肽键，有些蛋白质还包括二硫键。

3.一级结构是蛋白质空间构象和特定生物功能的基础。

四、蛋白质的二级结构

1.定义:多肽链主链按一定方向折叠卷曲，通过氢键形成局部空间构象。

2.主要的化学键：氢键。

3.基本类型：

a-螺旋

①3.6个氨基酸残基上升一圈，螺距0.54nm,每个aa上升0.15nm,右手螺旋。

②氢键：螺旋3.613。

③二面角：φ=-57°，ψ=-47°

④r-基团分布于螺旋外侧。

⑤影响因素：

1.同性电荷aa相斥。

2.侧链较大。

3.gly二面角广泛。

4.pro形不成氢键。

β-折叠

①两条或多条几乎完全伸展的肽链平行排列，通过链间氢键交联形成。主链呈锯齿状构象。

②相邻aa的轴心距0.35nm。

③侧链r交替分布在片层平面的上、下方。

④分平行式和反平行式。

β-转角

1.定义：蛋白质多肽链上的180°回折结构，也称发夹结构。

2.特点：

a.一般由4个连续的aa组成。

b.g1y和pro易出现在β-转角。

c.第1个aa残基c=0与第4个aa残基n-h之间形成氢键。

不规则卷曲:指肽链结构没有确定的规则性，靠氢键维持。

五、蛋白质的超二级结构

1.定义:几个相邻的二级结构单元组合并相互作用，形成规则的(空间上可识别的)二级结构组合。

2.常见类型：aa、βββ、βaβ。

六、蛋白质的结构域

1.定义:是球状蛋白的折叠单位。在超二级结构的基础上，多肽链进一步弯曲折叠成一个或多个(空间上可区分的)球形局部三维实体。

七、蛋白质的三级结构

1.定义:多肽链在二级结构、超二级结构和结构域的基础上，进一步卷曲折叠，形成更复杂的球形分子结构。即肽链中所有原子在三维空间中的相对排列位置。

2.化学键:疏水作用、离子键、氢键、范德华力等。

3.特点：

?亲水基团位于分子表面，形成亲水层面。（增加了蛋白质在细胞当中的溶解性）

?疏水基团位于分子内部，形成疏水核心。

（肌红蛋白）

八、蛋白质的四级结构

1.定义:由两个或两个以上亚单位或具有三级结构的亚单位通过二级键相互缔合形成的具有特定三维结构的缔合体。是寡聚蛋白质。

2.在四级结构中，每个具有完整三级结构的多肽称为亚基或单体。

3.亚基之间的结合力主要是疏水作用、氢键和离子键。有些蛋白质也有二硫键。

（血红蛋白）