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第十一章
蛋白质的生物合成
;第一节遗传密码;密码的第一个碱基5′;二、遗传密码的基本特征
1.遗传密码的连续性(commaless)
密码子之间没有任何起“标点”作用的空格,阅读mRNA时是连续的,一次阅读3个核苷酸(碱基).;2.遗传密码的不重叠性(nonoverlapping)
在绝大多数生物中,阅读mRNA时是以密码子为单位,不重叠地阅读。
少数大肠杆菌噬菌体的RNA基因组中部分基因的遗传密码是重叠的。;3.遗传密码具有简并性(degeneracy)
(1)除Met(AUG)和Trp(UGG)外,每个氨基酸都有两个或更多的密码子,这种现象称为密码子的简并性(degeneracy)。
(2)同义密码:同一个氨基酸的不同密码子称同义密码子(synonyms)。
(3)简并性的生物学意义
减少有害突变,对生物物种的稳定有一定意义。
(4)密码的简并性往往表现在密码子的第三位碱基上;;5.遗传密码的通用性和变异性
(1)通用性:指各种低等和高等生物,包括病毒、细菌及真核生物,基本上共用一套遗传密码.
(2)密码的变异性:目前已知线粒DNA(mtDNA)的编码方式与通用遗传密码子有所不同.;6.密码子有起始密码子和终止密码子
(1)起始密码子:AUG(Met)多数原核,真核生物
GUGUUG少数情况
(2)终止密码子:UAA、UAG和UGA
不编码任何氨基酸,又称为无义密码子(nonsensecodons)或终止密码子(chain-terminatingcodons),
它们单个或串联在一起用于多肽链翻译的结束,没有相应的tRNA存在。;许多原核生物在mRNA的起始密码子上游约10个核苷酸处(-10区),通常有一段富含嘌呤核苷酸的序列,与16SrRNA的3′端部分互补,有助于mRNA与核糖体小亚基的结合.该序列最初是由Shine-Dalgarno发现的,故称之为SD序列(Shine-Dalgarnosequence).;第二节核糖体;二、核糖体的结构;三核糖体的活性位点(大肠杆菌)
;四、核糖体的功能;第三节转移RNA的功能;3’;第四节蛋白质生物合成的分子机制;二、mRNA上翻译的方向
;三、原核生物蛋白质生物合成的分子机制;AA+ATP+EAA-AMP-E+PPi;20种氨基酸中每一种都有各自特异的氨酰-tRNA合成酶。
氨酰-tRNA合成酶具有高度的专一性,它既能识别相应的氨基酸(L-构型),又能识别与此氨基酸相对应的一个或多个tRNA分子;即使AA识别出现错误,此酶具有水解功能,可以将其水解掉。这种高度的专一性保证了氨基酸与其特定的tRNA准确匹配,从而使蛋白质的合成具有一定的保真性。
;(二)肽链合成的起始
1.70S起始复合物的形成
(1)起始氨基酸及起始tRNA;细菌中的起始因子:
IF1:结合在30S亚基上作为完全起始复合物的一部分,起稳定此复合物的作用。
IF2:结合到特异的起始tRNA(fMet-tRNAifMet),并将起始tRNA置于小亚基上。
IF3:30S小亚基特异地与mRNA起始部位结合需要IF3.IF3还作为70S核糖体的解离因素,产生30S亚基。;(三)肽链的延长
;原核生物蛋白质合成的延伸因子
;2.转肽:
1)肽酰基从P位转到A位,肽键的形成;
2)负责肽键合成的酶称为肽酰转移酶(peptityltransferase),简称转肽酶。
3)肽的转移是核糖体大亚基(50S或60S)的功能。
;3.脱落;4.移位:
1)核糖体向mRNA3′端移动一个密码子,移位导致肽酰-tRNA从A位点移出,进入P位点;空着的A位点为下一个密码子对应的氨酰-tRNA的进入作好准备。
2)需要1个GTP
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