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BGN基因在肾透明细胞癌进展与转移中的作用机制研究
中文摘要
背景肾透明细胞癌(clearcellrenalcellcarcinoma,ccRCC)是最常见的肾癌亚型,
早期临床表现不明显,绝大多数患者是通过体检发现的,有些患者发现时已经出现
远处转移的情况。因此寻找有效的分子靶点对于早期发现肾透明细胞癌、改善患者
预后具有重要意义。双糖链蛋白聚糖(Biglycan,BGN)属于富含亮氨酸的小蛋白多
糖家族(smallleucine-richproteoglycans,SLRP)的I类成员之一,参与胶原纤维的搭建
并介导细胞信号传导,是细胞外基质的重要成分,其过表达与肿瘤侵袭及不良预后
有关。但BGN在肾透明细胞癌进展和转移过程中的作用尚不清楚,因此,本项目利
用生物信息学结合细胞实验进一步探究BGN基因在肾透明细胞癌进展和转移过程
中的作用及机制。
方法收集TCGA、GTEX、GEO数据库关于BGN的数据信息并利用R语言及SPSS
进行差异分析、生存曲线分析及临床相关性分析。肿瘤与癌旁组织中BGN的表达
水平通过实时荧光定量PCR技术和HPA数据库中的免疫组化结果进行验证。此
外,我们通过CCK-8、克隆形成、划痕实验、Transwell实验分析了BGN对肾透明
细胞癌细胞系Caki-1和786-0的增殖、侵袭的影响。最终通过RNA测序、GO-KEGG
分析、GSEA分析、DO分析等进行差异基因分析,并利用免疫蛋白印迹实验
(WesternBlot,WB)实验验证BGN通过JNK信号通路发挥作用。
结果从数据库分析结果来看,与正常组织相比,BGN在多种肿瘤中的表达都有所
增加。而且和多种肿瘤的预后不良有关。根据TCGA、GTEX、GEO等数据库数
据分析和PCR结果分析显示,与正常肾组织相比,BGN在肾透明细胞癌组织中的
表达明显增多,且与临床预后不良有关。此外,我们进一步通过CCK-8实验验证
BGN敲减慢病毒的感染的肾透明细胞癌细胞Caki-1和786-0的细胞生长速度较对
照组降低。克隆形成实验结果表明BGN敲减后细胞增殖能力降低。Transwell实验
结果表明敲减BGN组细胞的侵袭能力较对照组下降。划痕实验结果表明敲减BGN
组细胞的细胞迁移能力较对照组有明显下降。最后,我们对敲减BGN后的Caki-1
细胞系进行了转录组测序。GO分析结果显示这些基因参与血管发育、血管形态形
成、泌尿生殖系统发育、细胞增殖等多个生物学过程;KEGG分析差异基因与包括
基底细胞癌、MAPK信号通路、癌症通路、轴突引导等机制相关;DO分析结果显
示BGN表达与癌症、肾脏疾病、泌尿系统疾病等相关。GSEA分析结果显示:BGN
主要参与DNA复制、皮肤表皮结构、ATP转运、氧化磷酸化等通路。对BGN敲减
后的肾透明细胞癌细胞系进行MAPK信号通路关键蛋白的验证,发现BGN通过JNK
信号通路发挥作用。
结论BGN基因在肾透明细胞癌中表达升高,且与ccRCC患者的不良预后相关。BGN
通过JNK信号通路介导肾透明细胞癌的增殖、迁移及侵袭能力。综上,BGN有望
成为ccRCC患者的预后指标和潜在的治疗靶点。
硕士研究生:夏汉清(泌尿外科学)
指导教师:王新生(教授)
关键词:肾透明细胞癌;双糖链蛋白聚糖;生物信息学;MAPK信号通路
EffectandMechanismofBiglycanontheProgressionandMetastasis
ofClearCell
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