网站大量收购独家精品文档,联系QQ:2885784924

高通量测序仪校准规范实验报告.pdf

  1. 1、本文档共16页,可阅读全部内容。
  2. 2、原创力文档(book118)网站文档一经付费(服务费),不意味着购买了该文档的版权,仅供个人/单位学习、研究之用,不得用于商业用途,未经授权,严禁复制、发行、汇编、翻译或者网络传播等,侵权必究。
  3. 3、本站所有内容均由合作方或网友上传,本站不对文档的完整性、权威性及其观点立场正确性做任何保证或承诺!文档内容仅供研究参考,付费前请自行鉴别。如您付费,意味着您自己接受本站规则且自行承担风险,本站不退款、不进行额外附加服务;查看《如何避免下载的几个坑》。如果您已付费下载过本站文档,您可以点击 这里二次下载
  4. 4、如文档侵犯商业秘密、侵犯著作权、侵犯人身权等,请点击“版权申诉”(推荐),也可以打举报电话:400-050-0827(电话支持时间:9:00-18:30)。
查看更多

国家计量技术规范规程制修订

《高通量测序仪校准规范》

(征求意见稿)

实验报告

中国计量科学研究院

2023年2月

实验报告

一、实验目的

验证《高通量测序仪校准规范》的适用性和可行性。

二、实验地点

高通量测序仪验证实验在北京诺禾致源生物信息科技有限公司、北京贝瑞和

康生物技术有限公司、北京六合华大基因科技有限公司、苏州元德友勤医学检验

所等。

三、环境条件

实验过程中环境温度均在(15-35)C,在校准过程中环境温度的变化均在

3C以内。实验过程中环境湿度均在(10-80)%RH在校准过程中环境湿度变化

均在5%RH以内。

四、实验仪器与实验设计

在验证实验中,共对illumina公司、华大智造、贝瑞基因不同8台,包含

NovaSeq6000(PE150/PE250)、NextSeqCN500(SE75/SE150)、MGI-2000(PE150)

(5种测序方式)高通量测序仪进行了30次验证实验。涵盖了市场上主要的高

通量测序仪生产厂家和制造厂家。在实验设计上,按照校准规范对不同品牌的高

通量测序仪进行校准,根据实验结果验证校准规范的可行性和有效性。

五、标准物质

实验使用可准确溯源、明确序列信息的片段化DNA序列标准物质。至少包

含两种以上明确量值信息的参考序列,且每种参考序列长度≥5kbp。参考序列

相对丰度的扩展不确定度≤15%(k2)。

六、实验结果

6.1NovaSeq6000高通量基因测序仪实验

根据校准规范的要求,采用混合标准物质对北京诺禾致源科技股份有限公司

的NovaSeq6000高通量基因测序仪进行了验证实验。按校准规范要求的程序进行

了Q20、Q30、GC含量、对比率、覆盖率、准确率等指标的检测,记录测量数据,

按规范中校准项目和校准方法规定计算结算了各项校准结果,按规范附录D规定

要求计算序列相对丰度偏差。验证试验条件和结果见表1。

表1NovaSeq6000高通量基因测序仪验证实验结果

客户名称北京诺禾致源生物科技有限公司

器具名称高通量基因测序仪

型号/规格NovaSeq6000(PE150)

出厂编号A00609

生产厂商Illumina

客户地址北京市朝阳区酒仙桥北路甲10号院301号楼101单元7层714室

校准日期2022年9月30日

校准环境条件及地点:

温度:24.0℃地点:

湿度:49.0%RH其它:/

依据《高通量基因测序仪校准作业指导书》对该仪器进行校准,结果如下:

基础信息

读长类型PE150

设备最大通量6T

一、读长总数(reads)重复性

测定值平均值重复性

123

reads5.34%

二、GC含量占比偏差

测定值平均值相对偏差

123

文档评论(0)

pvg-sha + 关注
实名认证
内容提供者

该用户很懒,什么也没介绍

1亿VIP精品文档

相关文档