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国家计量技术规范规程制修订
《高通量测序仪校准规范》
(征求意见稿)
实验报告
中国计量科学研究院
2023年2月
实验报告
一、实验目的
验证《高通量测序仪校准规范》的适用性和可行性。
二、实验地点
高通量测序仪验证实验在北京诺禾致源生物信息科技有限公司、北京贝瑞和
康生物技术有限公司、北京六合华大基因科技有限公司、苏州元德友勤医学检验
所等。
三、环境条件
实验过程中环境温度均在(15-35)C,在校准过程中环境温度的变化均在
3C以内。实验过程中环境湿度均在(10-80)%RH在校准过程中环境湿度变化
均在5%RH以内。
四、实验仪器与实验设计
在验证实验中,共对illumina公司、华大智造、贝瑞基因不同8台,包含
NovaSeq6000(PE150/PE250)、NextSeqCN500(SE75/SE150)、MGI-2000(PE150)
(5种测序方式)高通量测序仪进行了30次验证实验。涵盖了市场上主要的高
通量测序仪生产厂家和制造厂家。在实验设计上,按照校准规范对不同品牌的高
通量测序仪进行校准,根据实验结果验证校准规范的可行性和有效性。
五、标准物质
实验使用可准确溯源、明确序列信息的片段化DNA序列标准物质。至少包
含两种以上明确量值信息的参考序列,且每种参考序列长度≥5kbp。参考序列
相对丰度的扩展不确定度≤15%(k2)。
六、实验结果
6.1NovaSeq6000高通量基因测序仪实验
根据校准规范的要求,采用混合标准物质对北京诺禾致源科技股份有限公司
的NovaSeq6000高通量基因测序仪进行了验证实验。按校准规范要求的程序进行
了Q20、Q30、GC含量、对比率、覆盖率、准确率等指标的检测,记录测量数据,
按规范中校准项目和校准方法规定计算结算了各项校准结果,按规范附录D规定
要求计算序列相对丰度偏差。验证试验条件和结果见表1。
表1NovaSeq6000高通量基因测序仪验证实验结果
客户名称北京诺禾致源生物科技有限公司
器具名称高通量基因测序仪
型号/规格NovaSeq6000(PE150)
出厂编号A00609
生产厂商Illumina
客户地址北京市朝阳区酒仙桥北路甲10号院301号楼101单元7层714室
校准日期2022年9月30日
校准环境条件及地点:
温度:24.0℃地点:
湿度:49.0%RH其它:/
依据《高通量基因测序仪校准作业指导书》对该仪器进行校准,结果如下:
基础信息
读长类型PE150
设备最大通量6T
一、读长总数(reads)重复性
测定值平均值重复性
123
reads5.34%
二、GC含量占比偏差
测定值平均值相对偏差
123
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