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分子生物学研究技术;第一章
分子克隆的工具酶和载体;DNA重组技术中常用的工具酶;第一节工具酶
一、限制性核酸内切酶
1.限制-修饰系统的概念
LurvaHuman1952BertaniWeigle1953观察λ噬菌体
限制与修饰系统是细胞的一种防卫手段。各种细菌都能合成一种或几种能够切割DNA双链的核酸内切酶,它们以此来限制外源DNA存在于自身细胞内,但合成这种酶的细胞自身的DNA不受影响,因为这种细胞还合成了一种修饰酶,对自身的DNA进行了修饰,限制性酶对修饰过的DNA不能起作用。这种现象被称为寄主控制的限制与修饰现象。
;E.coliK;E.coliKE.coliBE.coliC;E.coliKE.coliBE.coliC;2.限制性内切酶,甲基化酶
实验结果说明K和B菌株中存在一种限制系统,可排除(分解)外来的DNA。
这种限制作用就是限制性内切酶作用的结果。
10-4的存活率(低),是由宿主修饰系统作用的结果。
修饰酶作用的结果,使外源DNA幸存下来。
修饰酶,如甲基化酶,
它能修饰限制酶作用位点的结构,而使其不能被限制酶切割。
甲基化碱基:AN6甲基-腺膘呤
C5‘甲基-胞嘧啶
;核酸酶(nucleases)是指所有可以水解核酸的酶。
按底物不同分为:
DNA酶(DNase)
RNA酶(RNase)
按作用部位不同分为:
5′末端外切酶
核酸外切酶
3′末端外切酶
核酸内切酶
限制性核酸内切酶:
有严格的序列依赖性,是基因工程中的重要工具酶。
;限制性核酸内切酶:;3.限制性核酸内切酶的类型及特性;限制性核酸内切酶的命名法
用属名的头一个字母和种名的头两个字母表示寄主菌的物种名称,如E.coli用Eco表示,所以用斜体字。
用一个字母代表菌株或型,如流感嗜血菌Rd菌株用d,即Hind。
如果一种特殊的寄主菌株,具有几个不同的限制与修饰体,则以罗马数字表示,如HindⅠ,HindⅡ,HindⅢ等。;第二类(II型)限制性内切酶:;二型限制性内切酶酶位点的分析
回文结构
“人过大佛寺,寺佛大过人”
“仙客来,来客仙”
“雾锁山头山锁雾”
“天连水尾水连天”
5’TGTGTGAATTGTACCGTACAATTCACACA-3’;;4.限??性内切酶产生的末端及其连接
(一)粘性末端;粘性末端;粘性末端连接;19;(二)平头末端:;平头末端;粘性末端与平头末端;;; ①产生5’突出粘性末端(cohesiveend):以EcoRI为例:
5’…G↓AATTC…3’→5’…GOHPTTAAC…3’
3’…CATAA↑G…5’EcoRI3…CTTAAPOHG…5‘
②产生3’突出的粘性末端:以PstⅠ为例:
5’…CTGCA↓G…3’→5’…CTGCAOHPG…3’
3’…G↑ACGTC…5’PstI3’…GPOHACGTC…5
③产生平末端(bluntend):NruⅠ为例:
5’…TCG↓CGA…3’→5’…TCGOHPCGA…3’
3’…AGC↑GCT…5’NruI3’…AGCPOHGCT…5’
;(三)同裂酶(Isoschizomers):
来源不同,但识别和切割位点相同的酶。
酶切DNA后,产生同样的切割,形成同样的末端。如:HpaII和MspI,其靶序列是CCGG
但对甲基化碱基的敏感性不同。如,HpaII敏感,而MspI中性。
(四)同尾酶(Isocaudamer):
来源不同,识别的靶序列不同,但产生的粘性末端相同的酶。 如:BamHI 与BglII
G↓GATCC A↓GATCA
一些识别4核苷酸序列包含在6个之中。
如:MboI和Sau3AI5’…↓GATC…3’
BamHI 5’…G↓GATCC…3’
一对同尾酶切割产生的粘性端连接后的位点叫“杂种位点”(hybridsite),不能再被原来任何一种酶所识别。
4、6碱基识别酶的切点在DNA链上随机分布的频率不同。;DNA被一种酶切、连接后,
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