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進位轉位成肽肽鏈延長的迴圈5’3’Nterminal十、肽鏈合成的終止
Termination當mRNA上終止密碼(UAA,UAG,UGA)出現後,多肽鏈合成停止,肽鏈從肽醯-tRNA中釋出,mRNA、核糖體等分離,這些過程稱為肽鏈合成終止。釋放因數(releasefactor,RF)原核釋放因數:RF-1,RF-2,RF-3真核釋放因數:eRF釋放因數的功能:識別終止密碼:RF-1特異識別UAA、UAG;而RF-2可識別UAA、UGA。誘導肽基轉移酶活性將新生多肽轉移給水,使肽鏈從核糖體上釋放。原核肽鏈合成終止過程
多肽醯-tRNA間酯鍵水解各組分解離UAG53RFCOO-Termination精確合成蛋白質的能量消耗——每一個肽鍵的形成需4個高能鍵氨醯-tRNA合成:ATP→AMP+PPi肽鏈延長(進位、轉位):2GTP→2GDP+2Pi蛋白合成旺盛的細菌或真核細胞中mRNA將核糖體串聯為多聚核糖體(polysome)——使蛋白質合成高速、高效進行。3’5’5’3’電鏡下的多聚核糖體
細菌中,轉錄和翻譯是緊密偶聯的活化染色體片段轉錄方向RNA聚合酶蛋白質合成方向真核細胞的翻譯與轉錄分區進行原核細胞真核細胞新生蛋白Ribosomelifecycle(核糖體循環)第五節
多肽鏈的折疊與加工從核糖體釋放出的新生多肽鏈不具備蛋白質生物活性,必需經過不同的翻譯後複雜加工過程才轉變為天然構象的功能蛋白。主要包括多肽鏈折疊(fold)為天然的三維(threedimension)結構翻譯後修飾(posttranslationalmodification)蛋白質的成熟新生多肽鏈折疊、結合輔因數(非共價修飾)糖基化、磷酸化、乙醯化等共價修飾與其他蛋白亞基結合成熟的功能性蛋白一、氨基末端和羧基末端的修飾N-端的Met(fMet)殘基,以及有些多肽鏈N-端的多個殘基或C-端的殘基都會被切除多數情況下,在肽鏈合成過程中,即當肽鏈的N端游離出核糖體後,立即進行去甲醯化。真核生物N端Met常常在肽鏈的其他部分還未完全合成時,就已經水解下來。約50%真核蛋白氨基端氨基被乙醯化;C端亦被修飾fMet-(aa)nMet(aa)n(aa)n或(aa)n-m去甲醯基酶氨肽酶二、信號序列(signalsequence)的切除前體蛋白成熟線粒體蛋白信號序列三、轉移RNA具有特徵性結構擺動位點四、氨醯-tRNA合成酶和它們催化的反應——氨基酸的活化氨醯-tRNA合成酶(aminoacyl-tRNAsynthetase)對底物氨基酸和tRNA都有高度特異性——絕對專一性(20種)總反應:氨基酸+tRNA氨醯-tRNAATPAMP+PPi氨醯-tRNA合成酶Mg2+第一步反應
氨基酸+ATP-E→氨醯-AMP-E+PPi氨醯-AMP-E+tRNA↓氨醯-tRNA+AMP+E第二步反應五、一些氨醯-tRNA合成酶具有校對(proofreading)功能tRNA指定其負載氨基酸在生長的多肽鏈中的位置——蛋白質合成準確性的關鍵氨醯-tRNA合成酶有校正功能:識別底物氨基酸、校正氨醯-AMP中間體、水解非正確組合的氨基酸與tRNA之間的酯鍵六、氨醯-tRNA合成酶對tRNA的識別
——第二遺傳密碼識別不同tRNA與識別氨基酸對蛋白合成準確性同樣重要;機制複雜tRNA複雜的分子構象及氨基酸臂、反密碼子臂對識別和相互作用都是重要的一些氨醯-tRNA合成酶識別tRNA反密碼子本身丙氨酸tRNA合成酶對tRNA的識別取決於tRNA氨基酸臂的G=U堿基對丙氨酸-tRNA合成酶對tRNA的識別能被丙氨酸-tRNA合成酶識別的微丙氨酸-tRNA七、一個特定氨基酸起始蛋白質的合成細胞中有2種tRNA區分起始密碼子-蛋氨酸AUG和肽鏈中蛋氨酸AUG密碼子原核生物:*fMet-tRNAfMet,Met-tRNAMet真核生物:‘Met-tRNAMet,Met-tRNAMet*N-formylmethionine:N-甲醯甲硫氨酸Met+tRNAfMet+ATP→Met-tRNAfMet+AMP+PPiN10-甲醯基四氫葉酸+Met-tRNAfMet→fMet-tRNAfMet+四氫葉酸fMet-tRNAfMet氨醯-tRNA的表示方法Ala-tRNAAlaa
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