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DNA的生物合成;DNA;DNA複製的概念:;複製的基本規律;複製的基本規律;一、半保留複製;圖12-1DNA複製理論上有三種可能形式;1958,M.MmlsonF.W.Stahl設計的實驗;按半保留複製方式,子代DNA與親代DNA的堿基序列一致,即子代保留了親代的全部遺傳資訊,體現了遺傳的保守性。;二、雙向複製;ori是指DNA複製起始時必需的一段特殊DNA序列。共同特徵:;A.環狀雙鏈DNA及複製起始點
B.複製中的兩個複製叉
C.複製接近終止點(termination,ter);;三、複製的半不連續性;半不連續性
複製過程中,領頭鏈連續複製,而隨從鏈不連續複製的現象。
岡崎片段(okazakifragment)
指不連續複製的片段
原核:1000~2000個核苷酸(nt)
(相當於1個順反子,即基因的大小)
真核:100~200個核苷酸(nt)
(相當於1個核小體DNA的大小);DNA複製的酶學和拓撲學變化;底物(substrate):
dATP,dGTP,dCTP,dTTP;(dNTP)
聚合酶(polymerase):
依賴DNA的DNA聚合酶,簡寫為DNA-pol;
範本(template):
解開成單鏈的DNA母鏈;
引物(primer):
提供3?-OH末端使dNTP可以依次聚合;
其他的酶和蛋白質因數。;一、複製的化學反應;活性:1.5??3?聚合酶活性,需要引物;
2.3??5?核酸外切酶活性。;DNA-pol的5′?3′聚合作用;3′?5′外切酶;(一)原核生物的DNA聚合酶;;功能:對複製中的錯誤進行校讀,對複製
和修復中出現的空隙進行填補。;只可沿5?→3?方向延長;;(2)DNA-polI3′?5′外切酶活性的功能;(3)DNA-polI5′?3′外切酶活性的功能;323個氨基酸;DNA-polⅡ(120kD);*由A.Kornberg的二兒子TomB.Kornberg發現的。;DNA-polⅢ同時合成領頭鏈和隨從鏈;;三、複製的保真性(fidelity);四、複製中的解鏈和DNA分子拓撲學變化;種類:解旋酶Ⅰ、Ⅱ、Ⅲ和rep蛋白;解螺旋酶和單鏈DNA結合蛋白協同作用;(二)引物酶(primase);是一種可逆的核酸酶,它既能水解DNA分子中的磷酸二酯鍵,又能將其重新連接;可快速消除DNA解鏈過程中所產生的正超螺旋累積,使複製叉能夠順利前進。;原核和真核生物都發現了三類拓撲異構酶:;DNA正超螺旋與負超螺旋;切割DNA雙鏈,??時不需ATP;爾後由ATP供能,使DNA分子成負超螺旋再連接切口。;五、DNA連接酶(DNAligase);在複製中起最後接合缺口(雙鏈中的單鏈
缺口)的作用;
在DNA修復、重組及剪接過程中起縫合缺
口的作用;
基因工程的重要工具酶之一。;;DNA生物合成過程;(一)複製的起始(initiation);;;(二)複製的延長(elongation);領頭鏈:合成一段RNA引物(比岡崎片段的引物
略長),開始合成後通常一直繼續下去。;;在營養豐富培養基,E.Coli每20分鐘即可分裂一次;其基因組堿基數為4.6×106bp,DNA為單點雙向複製,可推算出複製速度約115kb/min(1,900bp/s);;1.原核生物基因是環狀DNA,雙向複製的匯合
點就是複製的終止點。;2.終止區含有多個約22bp的終止子(terminator,ter);3.隨從鏈上不連續性片段的連接;WhenDNAreplicated,itsstrandsareseparatedbytheenzymehelicase.SinglestrandDNAbindingproteinkeepsthestrandfromre-annealing.OneDNAstrandwecalledtheleadingstrand,whichformfrom5primeto3primeend,usingDNApolymeraseIII,noproblemhere.Butthelaggingstrandpresentsprob
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