蛋白质的化学课件.pptVIP

鈣結合蛋白中結合鈣離子的模體鋅指結構它們可直接作為三級結構的“建築塊”或結構域的組成單位，是蛋白質構象中二級結構與三級結構之間的一個層次，故稱超二級結構纖連蛋白分子的結構域結構域大分子蛋白質中由於多肽鏈上相鄰的超二級結構緊密聯繫，進一步折疊形成一個或多個相對獨立的緻密的三維體，各行使其相應功能。（四）蛋白質的三級結構1.定義：是指整條多肽鏈所有的原子排布方式，即蛋白質多肽鏈在二級結構、超二級結構、結構域的基礎上，進一步盤繞、折疊形成的包括主鏈和側鏈構象在內的特定三維結構。相對獨立、近似球形的三維實體，具備三級結構的蛋白質才有生物學活性。?-螺旋?-折疊?-轉角無規捲曲無規捲曲限制性內切核酸酶BamHI的三級結構（示二級結構的幾種類型）2、維持三級結構的作用力——次級鍵氫鍵疏水鍵（疏水相互作用）——在水介質中球狀蛋白質的折疊總是傾向於把疏水殘基埋藏在分子的內部。這一現象稱為疏水相互作用。離子鍵（鹽鍵）二硫鍵範德華力一種普遍存在的作用力其中疏水鍵在蛋白質三級結構中起著重要作用，它是使蛋白質多肽鏈進行折疊的主要驅動力。（五）蛋白質的四級結構四級結構是指由兩個或兩個以上具有獨立三級結構的多肽鏈（稱亞基）借非共價鍵維繫、聚合而成的特定構象的蛋白質分子。1.定義2、亞基亞基是具有獨立三級結構的多肽鏈，又稱亞單位或單體、原聚體。通常亞基只有一條多肽鏈，但有的亞基由兩條或多條多肽鏈組成，這些多肽鏈間多以二硫鍵相連。亞基單獨存在時無生物學活性。四級結構中亞基可以是相同的或不相同的，亞基相同時，分子具有對稱性。寡聚體（2～10）多聚體（＞10）3.維持四級結構的主要作用力在蛋白質四級結構中，亞基之間的作用力主要包括：氫鍵、離子鍵、範德華力和疏水鍵。即亞基之間通過次級鍵彼此締合在一起（二硫鍵？）實質上：蛋白質的四級結構實際上研究亞基之間的相互作用、空間排布及亞基接觸部位的空間佈局。第四節蛋白質的結構與功能生物學功能蛋白質功能區（某部位特定構象）一級結構中某些氨基酸殘基一、蛋白質一級結構與功能的關係（一）一級結構是空間結構的基礎氨基酸→次級鍵例：牛胰核糖核酸酶天然狀態，（有催化活性）尿素、β-巰基乙醇去除尿素、β-巰基乙醇非折疊狀態（無活性）3.茚三酮反應氨基酸與茚三酮水合物共熱，可生成藍紫色化合物，其最大吸收峰在570nm處。由於此吸收峰值與氨基酸的含量存在正比關係，因此可作為氨基酸定量分析方法。（四）氨基酸的分離與分析（瞭解）自動氨基酸分析儀高效液相色譜（HPLC）離子交換層析生物質譜（MS）第三節、蛋白質的分子結構示例：

血紅蛋白一般可分為：一級結構、空間結構（構象）問題：1、蛋白質分子中氨基酸之間是怎麼連接的？2、不同蛋白質的氨基酸種類、數目、順序與其結構的複雜性與功能的多樣性關係？一、蛋白質的一級結構*肽鍵(peptidebond)是由一個氨基酸的?-羧基與另一個氨基酸的?-氨基脫水縮合而形成的化學鍵。1、肽鍵（一）肽鍵與肽+-HOH甘氨醯甘氨酸肽鍵*肽是由氨基酸通過肽鍵縮合而形成的化合物。*兩分子氨基酸縮合形成二肽，三分子氨基酸縮合則形成三肽……*由十個以內氨基酸相連而成的肽稱為寡肽(oligopeptide)，由更多的氨基酸相連形成的肽稱多肽(polypeptide)。2、肽N末端：多肽鏈中有自由氨基的一端C末端：多肽鏈中有自由羧基的一端多肽鏈有兩端*多肽鏈(polypeptidechain)是指許多氨基酸之間以肽鍵連接而成的一種結構。肽鏈中的氨基酸分子因為脫水縮合而基團不全，被稱為氨基酸殘基(residue)。N末端C末端牛核糖核酸酶3、幾種生物活性肽穀胱甘肽(glutathione,GSH)體內許多激素屬寡肽或多肽神經肽(neuropeptide)多肽類激素及神經肽（二）蛋白質的一級結構1.概念：指蛋白質多肽連中AA殘基的排列順序。主要化學鍵：肽鍵、二硫鍵組成蛋白質的多肽鏈數目.多肽鏈間或鏈內二硫鍵的數目和位置。多肽鏈的氨基酸數目，其中最重要的是多肽鏈的氨基酸順序，它是蛋白質生物功能的基礎。氨基酸序列是由基因的遺傳資訊即DNA分子中的核苷酸的序列決定的。要點：SerGlyIleValGluGlnCysCysThrIleCysSerLeuTyrGlnLe