蛋白质的三维结构课件.pptVIP

（二）結構域二級/超二級結構基礎上形成的特定區域結構域存在的原因：1、局域分別折疊比整條肽鏈折疊在動力學上更為合理2、結構域之間由肽鏈連接，有利於結構的調整免疫球蛋白的結構立體結構模型七、球狀蛋白質與三級結構(TertiaryStructure)——由二級結構元件構建成的總三維結構，包括一級結構中相距較遠的肽段間的幾何相互關係和側鏈在三維空間中彼此間的相互關係。

維繫力有氫鍵/疏水鍵/離子鍵/範德華力在二級結構基礎上包括主鏈和側鏈構象在內的三維結構（一）球狀蛋白質的分類：——根據其結構域分為4大類1、全α－結構（反平行α螺旋）蛋白質2、α，β－結構蛋白質O……（氫鍵）………H—C—（NH—CH—CO）2—N—R比較穩定的環狀結構主要存在於球狀蛋白分子中多數處在蛋白質分子的表面反平行β折疊片中的一種不規則排列實質上是多出來的一個AA殘基2、β凸起（βbugle）——泛指不能歸入明確的二級結構如折疊片和螺旋的多肽片斷。（四）無規捲曲（randomcoil）五、纖維狀蛋白質脊椎動物體中50%以上是纖維狀蛋白質支架、防護作用規則的線性結構纖維蛋白不溶性纖維蛋白（角蛋白、膠原蛋白、彈性蛋白）可溶性纖維蛋白（肌球蛋白血纖蛋白原）硬蛋白（一）?-角蛋白（Keratin）?-角蛋白硬-角蛋白強軟-角蛋白弱皮膚與皮膚的衍生物主要由?-螺旋構象的多肽鏈組成毛髮的結構大纖維鱗狀細胞皮層細胞微纖維微原纖維初原纖維α螺旋捲髮(燙髮)的生物化學基礎?角蛋白在濕熱條件下伸展轉變為?—構象，冷卻乾燥時可自發地恢復原狀。側鏈R基一般較大，不適於處在?—構象螺旋多肽鏈間有著很多的二硫鍵交聯——交聯鍵使外力解除後肽鏈恢復原狀燙髮時還原劑（二）?-角蛋白絲蛋白的結構（三）膠原蛋白(collagen)1、組織分佈與類型屬結構蛋白質使骨、腱、軟骨和皮膚具有機械強度2、AA組成皮膚中膠原蛋白肽鏈的96%是按三聯體(G1y—x—y)n順序重複排列Gly數目占殘基總數1/3X常為Pro，y常為Hy-Pro/Hy-Lys需Vc、是糖蛋白Gly3、結構4、膠原蛋白中的共價交聯分子內交聯由?肽組成至少有：?l(I)/?l(II)/?l(III)/?1(IV)和?2膠原蛋白I：[?1(I)]2?2三螺旋五種肽鏈AA順序不同，分子量介於95000到100000之間，含1000個殘基左右5、膠原蛋白的類型（四）彈性蛋白（elastin）由可溶性的單體合成是彈性蛋白纖維的基本單位含有各種各樣無規捲曲構象肌肉肌纖維束肌纖維肌原纖維（五）肌球蛋白和原肌球蛋白粗絲和細絲輕酶解肌球蛋白重酶解肌球蛋白頭片六、超二級結構與結構域（一）超二級結構若干相鄰的二級結構單元按照一定規律有規則組合在一起、相互作用，形成在空間構象上可彼此區別的二級結構組合單位。（5）二硫鍵(DisulfideBond)由含硫氨基酸形成起穩定肽鏈空間結構的作用二硫鍵被破壞，蛋白質生物活性喪失（6）配位鍵(Metal-ionCoordination)兩個原子之間形成的共價鍵共用電子對由其中一個原子提供金屬離子與蛋白質的結合方式例如：鐵氧還蛋白（7）酯鍵(EsterBond)Ser/Thr的羥基與AA的羧基形成酯鍵磷酸與含羥基AA縮合形成磷酸酯鍵（一）醯胺平面與α－碳原子的二面角三、多肽主鏈折疊肽平面鍵長和鍵角一定肽鍵的原子排列呈反式構型相鄰的肽平面構成兩面角肽鍵中C-N鍵具有部分雙鍵性質——組成醯胺的原子處於同一平面共振形式多肽鏈：通過可旋轉的Cα連接的醯胺平面鏈這種旋轉是受到限制的φ和ψ=0°時的主鏈構象（二）可允許的φ和ψ值：拉氏構象圖四、二級結構（SecondaryStructure）指肽鏈的主鏈在空間的排列,或規則的幾何走向、旋轉及折疊。只涉及主鏈構象及鏈內/間形成的氫鍵主要有?-螺旋、?-折疊、?-轉角、無規捲曲、?-螺旋、?環等。（一）?-螺旋（?-helix）1、?-螺旋的結構螺距0.54nm每圈含3.6個AA殘基每個AA殘基占0.15nm繞軸旋轉100°鏈內形成氫鍵與軸平行多為右手螺旋2、?-螺旋的特點