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2025年4月甘肃农业大学学报第60卷
第2期128~136JOURNALOFGANSUAGRICULTURALUNIVERSITY双月刊
DOI:10.13432/j.cnki.jgsau.2025.02.016
基于转录组的青海茄参CML基因家族鉴定及
冷胁迫表达分析
张雪,赵艳艳
(青海大学农牧学院,青海西宁810016)
摘要:【目的】鉴定青海茄参(MandragorachinghaiensisKuangetA.M.Jl)CML基因家族成员,探究其对冷胁
迫的响应。【方法】基于课题组的全长转录组数据,利用生物信息学技术对青海茄参CML基因家族的成员及其蛋白
理化性质、系统发育过程、基因结构等进行分析。【结果】在青海茄参中共鉴定出19个CML基因家族成员,亚细胞
定位主要在细胞核,含有1~4个EF-hand结构域,二三级结构主要由α-螺旋组成;基序分析发现,McCMLs蛋白含
有4个典型的EF手部基序;系统进化树分析显示,McCMLs蛋白被分为3个亚族。冷胁迫表达模式分析表明,
McCML基因家族在冷胁迫下差异表达,其中McCML3、McCML7表达量显著上调。【结论】通过对McCML基因家
族进行鉴定和分析,筛选出McCML3、McCML7作为青海茄参抗寒候选基因,为后期研究其抗寒分子机制提供理论
基础。
关键词:青海茄参;CML基因家族;生物信息学分析;冷胁迫;表达分析
中图分类号:S759.95文献标志码:A开放科学(资源服务)标识码(OSID):
文章编号:1003-4315(2025)02-0128-09
IdentificationandcoldstressexpressionanalysisofCMLgene
familyinMandragorachinghaiensisbasedontranscriptome
ZHANGXue,ZHAOYanyan
(CollegeofAgricultureandAnimalHusbandry,QinghaiUniversity,Xining810016,China)
Abstract【Objective】ThisstudyaimedtocidentifythemembersofCMLGenefamilyofMandragora
:
chinghaiensisandinvestigateitsregulatoryresponsetocoldstress.【Method】Full-lengthtranscriptome
datawereanalyzedusingbioinformaticstoolstoidentifytheCMLgenefamily,withsystematiccharacteriza‐
tionoftheirproteinphysicochemicalproperties,phylogeneticprocess,andgenestructure.【Result】Atotal
ofnineteenCMLgenefamilymemberswereidentifiedinM.chinghaiensis.Subcellularlocalizationanalysis
revealedthattheseproteinswereprimarily
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