广东紫珠matK基因的生物信息学分析.pdfVIP

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李家敏等广东紫珠基因的生物信息学分析种子第卷第期

matK431

广东紫珠matK基因的生物信息学分析

,,,

李家敏潘芝玲王灿张兵锋

(,)

宜春学院江西宜春

336000

:,、

摘要通过扩增获得广东紫珠基因的完整核苷酸序列利用生物信息学对基因进行开放阅读框氨

PCRmatKmatK

、、,、/、,

基酸组成蛋白质跨膜结构区亚细胞定位和结合区分析预测信号肽氨基酸亲疏水性氨基酸及高级结构预测采用

。,,

算法对种紫珠属植物构建系统进化树结果表明广东紫珠基因序列长度为编码个氨

UPGMA13matK1524bp507

,;,、

基酸有个开放阅读框基因编码的成熟酶蛋白含种氨基酸二级结构中螺旋占转角

10matKK20α49.11%β

、,;、,。

4.45%无规则卷曲28.21%为不稳定亲水性蛋白无信号肽无跨膜结构定位于叶绿体亚细胞器系统进化聚类结果

,、。

表明广东紫珠与紫珠Callicaramollis的亲缘关系较近

p

:;;;

关键词广东紫珠序列生物信息学序列分析

matK

:/

DOI10.16590.cnki.1001-4705.2024.01.130

j

中图分类号:文献标志码:文章编号:()

S567A1001-4705202401-0130-07

BioinformaticsAnalsisofmatKGeneinCallicarakwantunensisChun

ypgg

,,,

LIJiaminPANZhilinWANGCanZHANGBinf

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