半夏ARF转录因子家族的全基因组鉴定及生物信息学分析.pdfVIP

江苏农业学报(ＪｉａｎｇｓｕＪ.ｏｆＡｇｒ.Ｓｃｉ.)ꎬ２０２５ꎬ４１(６):１０９５￣１１０６

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朱志炎ꎬ张德清ꎬ周厚英ꎬ等.半夏ＡＲＦ转录因子家族的全基因组鉴定及生物信息学分析[Ｊ].江苏农业学报ꎬ２０２５ꎬ４１(６):１０９５￣１１０６.

ｄｏｉ:１０.３９６９/ｊ.ｉｓｓｎ.１０００￣４４４０.２０２５.０６.００６

半夏ＡＲＦ转录因子家族的全基因组鉴定及生物信息学

分析

１１２２２

朱志炎ꎬ张德清ꎬ周厚英ꎬ何勇ꎬ田志宏

(１.南通师范高等专科学校初等教育学院ꎬ江苏南通２２６０１０ꎻ２.长江大学生命科学学院ꎬ湖北荆州４３４０２５)

摘要:半夏(Ｐｉｎｅｌｌｉａｔｅｒｎａｔｅ)是一种重要的药用植物ꎬ其在生长过程中对光照和温度极为敏感ꎬ易发生倒苗现

象ꎬ导致产量降低ꎮ本研究基于国家生物信息中心发布的半夏基因组数据ꎬ鉴定出２５个ＰｔＡＲＦ家族成员ꎬ并通过

系统进化分析将其划分为４个亚族ꎮ蛋白质理化性质分析结果表明ꎬ半夏ＰｔＡＲＦ均为亲水性不稳定蛋白ꎬ大部分

ＰｔＡＲＦ定位于细胞核中ꎮ蛋白质三级结构预测结果显示ꎬ亲缘关系较近的ＰｔＡＲＦ家族成员的三级结构高度相似ꎬ

表明部分ＰｔＡＲＦ可能存在功能冗余ꎮ系统进化分析和共线性分析结果表明ꎬ半夏和水稻的ＡＲＦ基因亲缘关系较

近ꎮ半夏ＡＲＦ家族基因启动子区域中ꎬ数量最多的顺式作用元件为生物及非生物胁迫响应元件ꎬ其次是植物激素

响应元件ꎬ植物生长与发育响应元件数量最少ꎮ这一结果表明ꎬＰｔＡＲＦ可能广泛参与半夏对逆境胁迫的响应ꎮ进

一步的研究结果表明ꎬＰｔＡＲＦ能够响应弱光胁迫和高温胁迫ꎬ可能参与半夏倒苗和块茎发育的调控ꎮ本研究为半

夏抗逆育种及栽培技术优化提供了重要的理论依据ꎮ

关键词:半夏ꎻＡＲＦ转录因子家族ꎻ倒苗ꎻ生物信息学

中图分类号:Ｓ５６７.２文献标识码:Ａ文章编号:１０００￣４４４０(２０２５)０６￣１０９５￣１２

Ｇｅｎｏｍｅ￣ｗｉｄｅｉｄｅｎｔｉｆｉｃａｔｉｏｎａｎｄｂｉｏｉｎｆｏｒｍａｔｉｃｓａｎａｌｙｓｉｓｏｆｔｈｅＡＲＦｔｒａｎ￣

ｓｃｒｉｐｔｉｏｎｆａｃｔｏｒｆａｍｉｌｙｉｎＰｉｎｅｌｌｉａｔｅｒｎａｔａ

１１２２２

ＺＨＵＺｈｉｙａｎꎬＺＨＡＮＧＤｅｑｉｎｇꎬＺＨＯＵＨｏｕｙｉｎｇꎬＨＥＹｏｎｇꎬＴＩＡＮＺｈｉｈｏｎｇ

(１.ＣｏｌｌｅｇｅｏｆＥｌｅｍｅｎｔａｒｙＥｄｕｃａｔｉｏｎꎬＮａｎｔｏｎｇＮｏｒｍａｌＣｏｌｌｅｇｅꎬＮａｎｔｏｎｇ２２６０１０ꎬＣｈｉｎａꎻ２.ＣｏｌｌｅｇｅｏｆＬｉｆｅＳｃｉｅｎｃｅꎬＹａｎｇｔｚｅＵｎｉｖｅｒｓｉｔｙꎬＪｉｎｇｚｈｏｕ４３４０２５ꎬ

Ｃｈｉｎａ)

Ａｂｓｔｒａｃｔ:Ｐｉｎｅｌｌｉａｔｅｒｎａｔａｉｓａｎｉｍｐｏｒｔａｎｔｍｅｄｉｃｉｎａｌｐｌａｎｔ.Ｄｕｒｉｎｇｉｔｓｇｒｏｗｔｈꎬｉｔｉｓｅｘｔｒｅｍｅｌｙｓｅｎｓｉｔｉｖｅｔｏｌｉｇｈｔａｎｄ

ｔｅｍｐｅｒａｔｕｒｅꎬａｎｄｐｒｏｎｅｔｏｔｈｅｐｈｅｎｏｍｅｎｏｎｏｆｓｅｅｄｌｉｎｇｃｏｌｌａｐｓｅꎬｗｈｉｃｈｌｅａｄｓｔｏａｒｅｄｕｃｔｉｏｎｉｎｙｉｅｌｄ.Ｉｎｔｈｉｓｓｔｕｄｙꎬｂａｓｅｄｏｎ

ｔｈｅｇｅｎｏｍｉｃｄａｔａｏｆＰｉｎｅｌｌｉａｔｅｒｎａｔａｒｅｌｅａｓｅｄｂｙｔｈｅＣｈｉｎａＮａｔｉｏｎａｌＣｅｎｔｅｒｆｏｒＢｉｏｉｎｆｏｒｍａｔｉｏｎꎬ２５ｍｅｍｂｅｒｓｏｆｔｈｅＰｔＡＲＦ

ｆａｍｉｌｙｗｅｒｅｉｄｅｎｔｉｆｉｅｄａｎｄｄｉｖｉｄｅｄｉｎｔｏｆｏｕｒｓｕｂ￣ｆａｍｉｌｉｅｓｔｈｒｏｕｇｈｐｈｙｌｏｇｅｎｅｔｉｃａｎａｌｙｓｉｓ.Ｔｈｅｒｅｓｕｌｔｓｏ