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中国实验诊断学2025年5月第29卷第5期ChinJLabDiagn2025.Vol.29,No.5

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基于微阵列技术探究帕金森病相关免疫特征的研究

何敏1，赵琳琳1一，于倩，任彦学，汪煜楠，黄山，张惊宇1*

（1.哈尔滨医科大学附属第四医院神经内科，黑龙江哈尔滨150001；

2.哈尔滨医科大学附属第二医院神经内科，黑龙江哈尔滨150086）

摘要：目的利用公开的帕金森病（Parkinsonsdisease,PD)外周血的基因表达谱数据，通过免疫浸润分析其免

疫差异，利用差异基因分析、构建蛋白-蛋白相互作用（Protein-proteininteraction，PPI)网络，寻找PD新的潜在生物标

志物，为探究PD的相关免疫特征提供新的思路。方法本研究所用的基因转录组RNA测序数据（GSE6613和

GSE57475)和患者临床性状相关数据均来源于GEO数据库。外周血转录组数据包括50例PD、93例早期帕金森病

（EarlyParkinsonsdisease，EarlyPD）和71例年龄、性别匹配的健康对照（Healthycontrol,HC）样本。使用软件

CIBERSORT分别对3组样本进行免疫浸润分析，估算样本中特异免疫细胞丰度，利用ggplot2、pheatmap软件包进行

图片绘制。使用R包limma寻找3组样本数据之间的差异表达基因（Differentiallyexpressedgenes，DEGs），用R包

clusterProfiler对DEGs进行基因集富集分析（GeneSetEnrichmentAnalysis，GSEA）和基因本体论（GeneOntology，

GO)基因功能富集分析。利用软件Metascape对排名前40的DEGs进行下游分析，形成PPI网络，使用MCODE插

件对PPI网络进行功能模块筛选，挖掘核心网络相关标记基因，再次进行GO功能富集分析和GSEA基因富集分析。

最后通过从ImmpDb数据库下载免疫相关基因集（immunerelatedgenes，IRGs，n=1509）采用韦恩图求3组样本

DEGs与IRGs的交点，以鉴定重叠免疫相关差异基因，进一步后续分析。结果参考免疫相关基因集，一共发现32

个免疫反应相关基因集，其中EarlyPD患者与HC样本间免疫关键基因有11个；EarlyPD患者与PD患者间免疫关

键基因有18个；PD患者和HC样本间免疫关键基因有9个。结论发现由IL10、JAK1等组成的免疫反应标记基因

集在不同阶段PD的免疫反应指标存在异常，为进一步探究PD相关免疫特征提供了理论基础。

关键词：帕金森病；微阵列技术；免疫浸润；生物信息学分析；功能富集分析

D0I:10.3969/j.issn.1007-4287.2025.05.001

StudyonimmunecharacteristicsrelatedtoParkinsonsdiseasebasedonmicroarraytechnologyHEMin,ZHAOLin-

lin,YUQian,RENYanrue,WANGYunan,HUANGShan’,ZHANGJingyul*.(1.DepartmentofNeurolo-

gy,theFourthAffiliatedHospitalofHarbinMedicalUniversity,Harbin150001,China;2.DepartmentofNeurolo-

gy,theSecondAffiliatedHospitalofHarbinMedicalUniversity,Harbin150086,China)

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*Correspondingauthor:ZHANGJingyu,zhangjy2025@

Abstract:O