薄壳山核桃MADS基因家族的全基因组鉴定及生物信息学分析.pdfVIP

江苏农业学报(ＪｉａｎｇｓｕＪ.ｏｆＡｇｒ.Ｓｃｉ.)ꎬ２０２５ꎬ４１(６):１０８０￣１０９４

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方欣妍ꎬ何秀琼ꎬ黄丹ꎬ等.薄壳山核桃ＭＡＤＳ基因家族的全基因组鉴定及生物信息学分析[Ｊ].江苏农业学报ꎬ２０２５ꎬ４１

(６):１０８０￣１０９４.

ｄｏｉ:１０.３９６９/ｊ.ｉｓｓｎ.１０００￣４４４０.２０２５.０６.００５

薄壳山核桃ＭＡＤＳ基因家族的全基因组鉴定及生物

信息学分析

１ꎬ２１ꎬ２１ꎬ２１ꎬ２１ꎬ２１ꎬ２

方欣妍ꎬ何秀琼ꎬ黄丹ꎬ彭兵阳ꎬ孙佳雯ꎬ吕佳斌

(１.安徽农业大学林学与园林学院ꎬ安徽合肥２３００３６ꎻ２.林木资源培育安徽省重点实验室ꎬ安徽合肥２３００３６)

摘要:ＭＡＤＳ基因是一类重要的转录调控因子ꎬ具有广泛的生物学功能ꎬ参与多个物种的生长发育和信号传

导ꎬ在多个物种中的生物学特性已被鉴定ꎮ本研究通过生物信息学方法对薄壳山核桃的ＭＡＤＳ基因家族成员进行

鉴定分析ꎬ最终鉴定出８１个ＭＡＤＳ基因家族成员ꎬ不均匀分布在１６条染色体上ꎬ根据系统进化树分析结果ＭＡＤＳ

蛋白分为ｔｙｐｅ￣Ⅰ型(２０个)和ｔｙｐｅ￣Ⅱ型(６１个)ꎮ薄壳山核桃该家族基因具有较多顺式作用元件ꎬ植物激素响应元

件、逆境胁迫响应元件和光响应元件等ꎬ研究发现这些作用元件广泛存在于ＭＡＤＳ基因的启动子区域ꎬ表明ＭＡＤＳ

基因在薄壳山核桃适应环境变化及生长发育过程中充当重要角色ꎮ不同薄壳山核桃ＭＡＤＳ家族基因在不同组织

中和不同时期的表达量差异较大ꎬ如ＣｉＭＡＤＳ４６在茎、ＣｉＭＡＤＳ７在果实具有较高表达量ꎬＣｉＭＡＤＳ１１的表达量随着时

间推移递减ꎮＭＡＤＳ基因具有不同的组织特异性表达模式ꎬ推测ＭＡＤＳ基因家族可能在成花及果实发育过程中发

挥重要作用ꎬ在不同发育阶段具有一定程度的功能多样性ꎮ本研究结果为进一步研究ＣｉＭＡＤＳ基因功能与特性奠

定了基础ꎬ并为其他物种的ＭＡＤＳ基因家族成员的鉴定和表征提供参考ꎮ

关键词:薄壳山核桃ꎻＭＡＤＳ基因家族ꎻ生物信息学ꎻ表达分析

中图分类号:Ｓ６６４.１文献标识码:Ａ文章编号:１０００￣４４４０(２０２５)０６￣１０８０￣１５

Ｇｅｎｏｍｅ￣ｗｉｄｅｉｄｅｎｔｉｆｉｃａｔｉｏｎａｎｄｂｉｏｉｎｆｏｒｍａｔｉｃｓａｎａｌｙｓｉｓｏｆｔｈｅＭＡＤＳｇｅｎｅ

ｆａｍｉｌｙｉｎＣａｒｙａｉｌｌｉｎｏｉｎｅｎｓｉｓ(Ｗａｎｇｅｎｈ.)Ｋ.Ｋｏｃｈ

１ꎬ２１ꎬ２１ꎬ２１ꎬ２１ꎬ２１ꎬ２

ＦＡＮＧＸｉｎｙａｎꎬＨＥＸｉｕｑｉｏｎｇꎬＨＵＡＮＧＤａｎꎬＰＥＮＧＢｉｎｇｙａｎｇꎬＳＵＮＪｉａｗｅｎꎬＬＹＵＪｉａｂｉｎ

(１.ＳｃｈｏｏｌｏｆＦｏｒｅｓｔｒｙａｎｄＬａｎｄｓｃａｐｅＡｒｃｈｉｔｅｃｔｕｒｅꎬＡｎｈｕｉＡｇｒｉｃｕｌｔｕｒａｌＵｎｉｖｅｒｓｉｔｙꎬＨｅｆｅｉ２３００３６ꎬＣｈｉｎａꎻ２.ＡｎｈｕｉＰｒｏｖｉｎｃｉａｌＫｅｙＬａｂｏｒａｔｏｒｙｏｆＦｏｒｅｓｔＲｅ￣

ｓｏｕｒｃｅｓａｎｄＳｉｌｖｉｃｕｌｔｕｒｅꎬＨｅｆｅｉ２３００３６ꎬＣｈｉｎａ)

Ａｂｓｔｒａｃｔ:ＴｈｅＭＡＤＳｇｅｎｅｓａｒｅａｃｌａｓｓｏｆｉｍｐｏｒｔａｎｔｔｒａｎｓｃｒｉｐｔｉｏｎａｌｒｅｇｕｌａｔｏｒｙｆａｃｔｏｒｓꎬｗｉｔｈｅｘｔｅｎｓｉｖｅｂｉｏｌｏｇｉｃａｌｆｕｎｃ￣

ｔｉｏｎｓ.Ｔｈｅｙａｒｅｉｎｖｏｌｖｅｄｉｎｔｈｅｇｒｏｗｔｈꎬｄｅｖｅｌｏｐｍｅｎｔꎬａｎｄｓｉｇｎａｌｔｒａｎｓｄｕｃｔｉｏｎｏｆｍｕｌｔｉｐｌ