- 1、原创力文档(book118)网站文档一经付费(服务费),不意味着购买了该文档的版权,仅供个人/单位学习、研究之用,不得用于商业用途,未经授权,严禁复制、发行、汇编、翻译或者网络传播等,侵权必究。。
- 2、本站所有内容均由合作方或网友上传,本站不对文档的完整性、权威性及其观点立场正确性做任何保证或承诺!文档内容仅供研究参考,付费前请自行鉴别。如您付费,意味着您自己接受本站规则且自行承担风险,本站不退款、不进行额外附加服务;查看《如何避免下载的几个坑》。如果您已付费下载过本站文档,您可以点击 这里二次下载。
- 3、如文档侵犯商业秘密、侵犯著作权、侵犯人身权等,请点击“版权申诉”(推荐),也可以打举报电话:400-050-0827(电话支持时间:9:00-18:30)。
- 4、该文档为VIP文档,如果想要下载,成为VIP会员后,下载免费。
- 5、成为VIP后,下载本文档将扣除1次下载权益。下载后,不支持退款、换文档。如有疑问请联系我们。
- 6、成为VIP后,您将拥有八大权益,权益包括:VIP文档下载权益、阅读免打扰、文档格式转换、高级专利检索、专属身份标志、高级客服、多端互通、版权登记。
- 7、VIP文档为合作方或网友上传,每下载1次, 网站将根据用户上传文档的质量评分、类型等,对文档贡献者给予高额补贴、流量扶持。如果你也想贡献VIP文档。上传文档
948陆军军医大学学报,2025,47(9)http://aammt.tmmu.edu.cn
DOI10.16016/j.2097-0927.202412012
:
基于生物信息学和机器学习鉴定慢性阻塞性肺病合并肺动脉高压标志物及实验验证
1112313
杨燕,陶春容,朱佑君,张聪,李德峰陆军军医大学(第三军医大学)第二附属医院:心内科,临床医
2
学研究中心,重庆;陆军军医大学(第三军医大学)基础医学院实验动物学教研室,重庆
[摘要]目的利用生物信息学筛选诊断慢性阻塞性肺病(chronicobstructivepulmonarydisease,
COPD)合并肺动脉高压(pulmonaryarterialhypertension,PAH)的关键生物标志物,并验证其临床意义。
方法通过高通量测序数据分析鉴定了COPD合并PAH的差异表达基因(differentiallyexpressed
genes,DEGs),并通过功能富集分析探讨了这些基因的生物学功能。利用最小绝对收缩与选择算子
(leastabsoluteshrinkageandselectionoperator,LASSO)、随机森林(randomforest,RF)、支持向量机递归
特征消除(supportvectormachine-recursivefeatureelimination,SVM-RFE)机器学习方法筛选出5个潜在
的生物标志物。通过单细胞分析揭示了关键基因在巨噬细胞中的表达模式。提取肺组织巨噬细胞进
行细胞水平验证,观察肺PAH关键生物标志物表达差异。通过外周血单个核细胞(peripheralblood
mononuclearcells,PBMC)数据验证关键生物标志物临床意义。利用缺氧方法建立COPD合并PAH小
鼠模型,将16只8周龄普通级COPD小鼠(雌雄不限,体质量20~22g)按随机数字抽样法分为(n=8):缺
氧组(氧浓度为10%±0.5%,COPD合并PAH组)和常氧组(COPD组)。使用免疫荧光技术标记关键生
物标志物,计算表达情况。结果COPD合并PAH筛选出28个DEGs(|LogFC|≥2,P0.05)。功能富
2
集分析显示,COPD合并PAH的DEGs与主要组织相容性复合体(majorhistocompatibilitycomplex,MHC)
Ⅱ和细胞分裂相关,参与溶酶体、氧化磷酸化及细胞周期通路(P0.05)。机器学习得到5个潜在的生
物标志物(GRN、KLF4、SHTN1、LRP1和GPNMB),进一步的单细胞分析揭示了这些标志物在疾病发展
中存在逆向表达模式。从PBMCs中构建的诺模图模型,用于诊断COPD合并PAH[受试者操作曲线下
面积(areaunderthesubjectcurve,AUC)为0.907]。COPD合并PAH组GRN、KLF4、SHTN1、LRP1和
GPNMB蛋白和基因显著高表达(P0.05)。结论本研究发现了GRN、KLF4、SHTN1、LRP1和GPNMB可
作为COPD合并PAH预测和诊断的关键生物标志物,为COPD合并PAH的临床治
您可能关注的文档
- 大功率发动机轴瓦失效分析及预防措施.pdf
- 七星渠灌区信息化改造及效果分析.pdf
- 意大利蜜蜂DnaJC28的生物信息学分析.pdf
- 玉米ZmMAPKKK21基因的克隆和生物信息学分析.pdf
- ORC发电机组不锈钢换热管裂漏失效机制分析及预防.pdf
- 白桦BpHsfA4a基因克隆及生物信息学分析.pdf
- 水稻PEPCK基因家族的生物信息学和表达分析.pdf
- 如何发展公平且有质量的教育——基于芬兰学习权方案的分析与启示.pdf
- 近10年国外远程办公研究进展与本土化启示——基于CiteSpace的可视化分析.pdf
- IL-6借助细胞焦亡刺激主动脉夹层的进展:一项基于已有数据库的差异性分析.pdf
- 创新与突破:《义务教育信息科技课程标准(2022年版)》的变化特色分析与启示.pdf
- 儿童青少年有氧耐力变化趋势的分析及启示——基于1964—2017年的国内外研究.pdf
- 国内外文化经济学研究进展与比较启示——基于Journal of Cultural Economics的文献分析.pdf
- 巴西“8.15”大停电事故分析及启示.pdf
- 低磷胁迫大豆CHX基因家族生物信息学分析.pdf
- 粤港澳大湾区背景下在粤香港地区大学生国家认同影响因素及启示——基于结构方程模型分析.pdf
- 美国科研人员数据管理需求分析及启示.pdf
- PitNET侵袭的特征基因筛选及CASR调控的生物信息学分析.pdf
- hsa-miR-449a靶基因预测及生物信息学分析.pdf
- 基于转录组的青海茄参CML基因家族鉴定及冷胁迫表达分析.pdf
最近下载
- 黑龙江农业工程职业学院单招数学模拟试题(附答案).docx VIP
- 2025读书心得:屏幕时代如何重塑孩子的自控力.docx VIP
- 中国艰难梭菌感染诊断、治疗与预防指南(2024)详细解读PPT课件.pptx VIP
- 第14课《我们都是中国人》第2课时 这是我国的标志 教案设计 2025道德与法治二年级上册.docx
- 湘少版四年级上册、下册的英语单词默写表.pdf VIP
- GBT 危险货物运输应急救援指南 第1部分:一般指南.pdf VIP
- 煤炭掺配合同范本.docx VIP
- 汽车整体认识(汽车发展史)-精.ppt VIP
- 生产安全事故现场处置方案.docx VIP
- 小学数学二年级下册应用题练习.docx VIP
人力资源管理师持证人
专注于各类文档、文案、文稿的写作、修改、润色和各领域PPT文档的制作,收集有海量各类规范类文件。欢迎咨询!
文档评论(0)