‘贵紫麦1号’生长素内输基因GzLAX3-1B的克隆及生物信息学分析.pdfVIP

分子植物育种，2024年，第22卷，第6期，第1759-1766页

MolecularPlantBreeding2024,Vol.22,No.6,1759-1766

研究报告

ResearchReport

贵紫麦1号生长素内输基因GzLAX3-1B的克隆及生物信息学分析

安畅李鲁华杨文荟熊富敏王颖茜任明见徐如宏*

贵州大学农学院，国家小麦改良中心贵州分中心，贵阳，550025

*通信作者，xrhgz@163.com

摘要为了研究小麦生长素内输基因LAX3在小麦生长发育中的功能。本研究利用RT-PCR方法从‘贵

紫麦1号’中获取GzLAX3-1B基因cDNA序列全长，并对该基因及其编码蛋白进行生物信息学分析。结果

显示：GzLAX3-1B基因开放阅读框(ORF)为1587bp，编码528个氨基酸，具有PLN03074特异性位点，属于

SLC5-6-like-sbd超家族。其编码的蛋白含有44个磷酸化位点和10个跨膜结构，是一种无信号肽的不稳定

疏水性质膜蛋白。系统进化关系结果表明：‘贵紫麦1号GzLAX3-1B基因与野生二粒小麦、大麦和油棕的亲

缘关系最近。本研究结果为进一步开展小麦LAX3的生物学功能研究提供一定的理论基础和依据。

关键词贵紫麦1号；GzLAX3-1B;基因克隆；生物信息学分析

CloningandBioinformaticsAnalysisofAuxinInputGeneGzLAX3-1Bof

GuizimaiNo.1

AnChangXuRuhong

gLiLuhuaXiongFuminWangYingxi

YangWenhuiRenMingjian

GuizhouSubcenterofNationalWheatImprovementCenter,CollegeofAgriculture,GuizhouUniversity,Guiyang,550025

*Corresniifhrhgz@163.com

DOI:10.13271/j.mpb.022.001759

AbstractInordertostudythefunctionofauxingeneLAX3inwheatgrowthanddevelopment.Inthisstudy,the

full-lengthcDNAsequenceofGzLAX3-1BgenewasobtainedfromGuizimaiNo.1byRT-PCR,andthebioinfor-

maticsanalysisofthegeneanditsencodedproteinwascarriedout.Theresultsshowedthattheopenreadingframe

(ORF)ofGzLAX3-1Bgenewas1587bp,encoding528aminoacids,withPLN03074specificsite,belongingto

SLC5-6-like-sbdsuperfamily.Itencodesaproteinwith44phosphorylationsitesand10transmembranestructures,

whichisanunstablehydrophobicplasmamembraneproteinwithoutsignalpeptide.Theresultsofphylogeneticanal-

ysisshowedthattheGzLAX3-1BgeneofGuizimaiNo.1wascloselyrelatedtowildemmerwheat,barleyandoil

palm.TheresultsofthisstudyprovideatheoreticalbasisforfurtherstudyonbiologicalfunctionofwheatLAX.

KeywordsGuizimaiNo.1;GzLAX3-