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分子植物育种,2025年,第23卷,第8期,第2497-2510页
MolecularPlantBreeding,2025,Vol.23,No.8,2497-2510
研究报告
ResearchReport
葡萄IDD基因家族鉴定及生物信息学分析
1223452,4*
赵士粤马文培黎霖聂鸿飞叶文秀李桂荣纪薇
1山西农业大学果树研究所,太原,030031;2山西农业大学园艺学院,太谷,030801;3永济市农业农村局,运城,044500;4北京大学现代农业研
究院,潍坊,261000;5河南科技学院园艺园林学院,新乡,453003
*通信作者,jiweiputao@163.com
摘要IDD(INDETERMINATEDOMAIN)蛋白是一类特殊的植物转录因子,它广泛地参与植物的生长和
逆境反应,然而IDD基因家族在葡萄中仍缺乏系统鉴定。本研究从公布的葡萄基因组数据库中,筛选出6个
VvIDD基因,并用生物信息学技术对其基因的染色体定位、理化性质、结构功能、系统发育、表达特性等方面
进行分析。结果表明:鉴定到分布在葡萄4条染色体上的6个VvIDD家族基因,并命名为~。
VvIDD1VvIDD6
所有IDD蛋白均是亲水性的蛋白,没有跨膜结构和信号肽,在蛋白质的二级结构中-螺旋和无规卷曲含量
琢
最多,三级结构既存在保守性又存在差异性。系统发育分析发现在VvIDD基因序列3端均包含1个较长的
外显子。通过构建拟南芥、水稻、苹果和葡萄的系统发育树,IDD基因家族成员可被划分为6个群体。顺式作
用元件分析结果显示,VvIDD基因的上游启动子序列中含有大量光响应元件和激素响应元件,推测其与植
物生长发育存在着一定的联系。通过对VvIDD基因的特异表达研究,发现大多数VvIDD基因在花后2和
10周的表达水平较高,推测IDD基因可能在葡萄生长期、转色期起重要作用。本研究为深入了解葡萄
VvIDD基因家族的结构和功能提供理论依据。
关键词葡萄;IDD基因家族;生物信息学
IdentificationandBioinformaticsAnalysisofIDDGeneFamilyinVitis
vinifera
1223452,4*
ZhaoShiyueMaWenpeiLiLinNieHongfeiYeWenxiuLiGuirongJiWei
1InstituteofPomology,ShanxiAgriculturalUniversity,Taiyuan,030031;2CollegeofHorticulture,ShanxiAgriculturalUniversity,Taigu,030801;
3YongjiMunicipalAgricultureandRuralAffairsBureau,Yuncheng,044500;4InstituteofModernAgriculture,PekingUniversity,Weifang,261000;
5CollegeofHorticultureandLandscapeArchitecture,HenanUniversityofScienceandEconomics,Xinxiang,453003
*Correspondingauthor,jiweiputao@163.com
DOI:10.13271/j.mpb.023.002497
AbstractTheIDD(INDETERMINATEDOMAIN)familyproteinisauniquetranscriptionfactorofplants,
whichiswidelyinvolvedinallstagesofplantgrowthandadversityre
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